Protein–RNA interactions for Protein: Q9P035

HACD3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD3Q9P035 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HACD3Q9P035 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HACD3Q9P035 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HACD3Q9P035 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HACD3Q9P035 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HACD3Q9P035 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HACD3Q9P035 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HACD3Q9P035 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HACD3Q9P035 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HACD3Q9P035 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HACD3Q9P035 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HACD3Q9P035 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HACD3Q9P035 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HACD3Q9P035 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HACD3Q9P035 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HACD3Q9P035 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HACD3Q9P035 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HACD3Q9P035 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HACD3Q9P035 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HACD3Q9P035 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HACD3Q9P035 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HACD3Q9P035 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HACD3Q9P035 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HACD3Q9P035 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HACD3Q9P035 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HACD3Q9P035 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HACD3Q9P035 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HACD3Q9P035 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HACD3Q9P035 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HACD3Q9P035 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HACD3Q9P035 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HACD3Q9P035 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HACD3Q9P035 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HACD3Q9P035 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HACD3Q9P035 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HACD3Q9P035 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HACD3Q9P035 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HACD3Q9P035 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HACD3Q9P035 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HACD3Q9P035 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HACD3Q9P035 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HACD3Q9P035 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HACD3Q9P035 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HACD3Q9P035 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HACD3Q9P035 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HACD3Q9P035 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HACD3Q9P035 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HACD3Q9P035 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HACD3Q9P035 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HACD3Q9P035 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HACD3Q9P035 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HACD3Q9P035 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HACD3Q9P035 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HACD3Q9P035 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HACD3Q9P035 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HACD3Q9P035 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HACD3Q9P035 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HACD3Q9P035 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HACD3Q9P035 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HACD3Q9P035 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HACD3Q9P035 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HACD3Q9P035 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HACD3Q9P035 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HACD3Q9P035 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HACD3Q9P035 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HACD3Q9P035 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HACD3Q9P035 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HACD3Q9P035 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HACD3Q9P035 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HACD3Q9P035 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HACD3Q9P035 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HACD3Q9P035 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HACD3Q9P035 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HACD3Q9P035 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HACD3Q9P035 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HACD3Q9P035 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HACD3Q9P035 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HACD3Q9P035 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HACD3Q9P035 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HACD3Q9P035 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HACD3Q9P035 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HACD3Q9P035 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HACD3Q9P035 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HACD3Q9P035 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HACD3Q9P035 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HACD3Q9P035 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HACD3Q9P035 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HACD3Q9P035 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HACD3Q9P035 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HACD3Q9P035 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HACD3Q9P035 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HACD3Q9P035 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HACD3Q9P035 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HACD3Q9P035 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HACD3Q9P035 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HACD3Q9P035 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HACD3Q9P035 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HACD3Q9P035 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HACD3Q9P035 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HACD3Q9P035 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms