Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU7

CABP1, Calcium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP1Q9NZU7 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CABP1Q9NZU7 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CABP1Q9NZU7 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CABP1Q9NZU7 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CABP1Q9NZU7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CABP1Q9NZU7 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CABP1Q9NZU7 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CABP1Q9NZU7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CABP1Q9NZU7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CABP1Q9NZU7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CABP1Q9NZU7 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CABP1Q9NZU7 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CABP1Q9NZU7 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CABP1Q9NZU7 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CABP1Q9NZU7 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CABP1Q9NZU7 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CABP1Q9NZU7 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CABP1Q9NZU7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CABP1Q9NZU7 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CABP1Q9NZU7 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CABP1Q9NZU7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CABP1Q9NZU7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CABP1Q9NZU7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CABP1Q9NZU7 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CABP1Q9NZU7 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CABP1Q9NZU7 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CABP1Q9NZU7 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CABP1Q9NZU7 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CABP1Q9NZU7 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CABP1Q9NZU7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CABP1Q9NZU7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CABP1Q9NZU7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CABP1Q9NZU7 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CABP1Q9NZU7 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CABP1Q9NZU7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CABP1Q9NZU7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CABP1Q9NZU7 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CABP1Q9NZU7 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CABP1Q9NZU7 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CABP1Q9NZU7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CABP1Q9NZU7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CABP1Q9NZU7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CABP1Q9NZU7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CABP1Q9NZU7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CABP1Q9NZU7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CABP1Q9NZU7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CABP1Q9NZU7 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CABP1Q9NZU7 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CABP1Q9NZU7 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CABP1Q9NZU7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CABP1Q9NZU7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CABP1Q9NZU7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CABP1Q9NZU7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CABP1Q9NZU7 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CABP1Q9NZU7 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CABP1Q9NZU7 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
CABP1Q9NZU7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CABP1Q9NZU7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CABP1Q9NZU7 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CABP1Q9NZU7 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CABP1Q9NZU7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CABP1Q9NZU7 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CABP1Q9NZU7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CABP1Q9NZU7 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CABP1Q9NZU7 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
CABP1Q9NZU7 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CABP1Q9NZU7 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CABP1Q9NZU7 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CABP1Q9NZU7 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CABP1Q9NZU7 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
CABP1Q9NZU7 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CABP1Q9NZU7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CABP1Q9NZU7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CABP1Q9NZU7 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CABP1Q9NZU7 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CABP1Q9NZU7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CABP1Q9NZU7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CABP1Q9NZU7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CABP1Q9NZU7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CABP1Q9NZU7 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CABP1Q9NZU7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CABP1Q9NZU7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CABP1Q9NZU7 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CABP1Q9NZU7 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CABP1Q9NZU7 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CABP1Q9NZU7 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CABP1Q9NZU7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CABP1Q9NZU7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CABP1Q9NZU7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CABP1Q9NZU7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CABP1Q9NZU7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CABP1Q9NZU7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CABP1Q9NZU7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CABP1Q9NZU7 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
CABP1Q9NZU7 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CABP1Q9NZU7 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CABP1Q9NZU7 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CABP1Q9NZU7 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CABP1Q9NZU7 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CABP1Q9NZU7 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms