Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR1

TMOD2, Tropomodulin-2, humanhuman

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD2Q9NZR1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMOD2Q9NZR1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMOD2Q9NZR1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMOD2Q9NZR1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMOD2Q9NZR1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMOD2Q9NZR1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMOD2Q9NZR1 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMOD2Q9NZR1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMOD2Q9NZR1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMOD2Q9NZR1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMOD2Q9NZR1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMOD2Q9NZR1 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMOD2Q9NZR1 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TMOD2Q9NZR1 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMOD2Q9NZR1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMOD2Q9NZR1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMOD2Q9NZR1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMOD2Q9NZR1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMOD2Q9NZR1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMOD2Q9NZR1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMOD2Q9NZR1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TMOD2Q9NZR1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMOD2Q9NZR1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMOD2Q9NZR1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMOD2Q9NZR1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMOD2Q9NZR1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMOD2Q9NZR1 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMOD2Q9NZR1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMOD2Q9NZR1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMOD2Q9NZR1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMOD2Q9NZR1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMOD2Q9NZR1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMOD2Q9NZR1 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMOD2Q9NZR1 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMOD2Q9NZR1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMOD2Q9NZR1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMOD2Q9NZR1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMOD2Q9NZR1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMOD2Q9NZR1 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMOD2Q9NZR1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMOD2Q9NZR1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMOD2Q9NZR1 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMOD2Q9NZR1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMOD2Q9NZR1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMOD2Q9NZR1 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMOD2Q9NZR1 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMOD2Q9NZR1 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TMOD2Q9NZR1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMOD2Q9NZR1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMOD2Q9NZR1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMOD2Q9NZR1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMOD2Q9NZR1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMOD2Q9NZR1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMOD2Q9NZR1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMOD2Q9NZR1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMOD2Q9NZR1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMOD2Q9NZR1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMOD2Q9NZR1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMOD2Q9NZR1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMOD2Q9NZR1 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TMOD2Q9NZR1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TMOD2Q9NZR1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMOD2Q9NZR1 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMOD2Q9NZR1 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMOD2Q9NZR1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMOD2Q9NZR1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMOD2Q9NZR1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMOD2Q9NZR1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMOD2Q9NZR1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMOD2Q9NZR1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMOD2Q9NZR1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMOD2Q9NZR1 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMOD2Q9NZR1 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMOD2Q9NZR1 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMOD2Q9NZR1 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMOD2Q9NZR1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMOD2Q9NZR1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMOD2Q9NZR1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMOD2Q9NZR1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TMOD2Q9NZR1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMOD2Q9NZR1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMOD2Q9NZR1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMOD2Q9NZR1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMOD2Q9NZR1 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMOD2Q9NZR1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMOD2Q9NZR1 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TMOD2Q9NZR1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TMOD2Q9NZR1 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMOD2Q9NZR1 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMOD2Q9NZR1 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMOD2Q9NZR1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMOD2Q9NZR1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMOD2Q9NZR1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMOD2Q9NZR1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMOD2Q9NZR1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TMOD2Q9NZR1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMOD2Q9NZR1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMOD2Q9NZR1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMOD2Q9NZR1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMOD2Q9NZR1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
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