Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY59

SMPD3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD3Q9NY59 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMPD3Q9NY59 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMPD3Q9NY59 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMPD3Q9NY59 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMPD3Q9NY59 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMPD3Q9NY59 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMPD3Q9NY59 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMPD3Q9NY59 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMPD3Q9NY59 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMPD3Q9NY59 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMPD3Q9NY59 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMPD3Q9NY59 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMPD3Q9NY59 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMPD3Q9NY59 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMPD3Q9NY59 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMPD3Q9NY59 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMPD3Q9NY59 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMPD3Q9NY59 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMPD3Q9NY59 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMPD3Q9NY59 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SMPD3Q9NY59 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMPD3Q9NY59 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMPD3Q9NY59 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMPD3Q9NY59 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMPD3Q9NY59 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SMPD3Q9NY59 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMPD3Q9NY59 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMPD3Q9NY59 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMPD3Q9NY59 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMPD3Q9NY59 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMPD3Q9NY59 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMPD3Q9NY59 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMPD3Q9NY59 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMPD3Q9NY59 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMPD3Q9NY59 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMPD3Q9NY59 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMPD3Q9NY59 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMPD3Q9NY59 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SMPD3Q9NY59 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMPD3Q9NY59 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMPD3Q9NY59 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMPD3Q9NY59 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMPD3Q9NY59 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMPD3Q9NY59 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMPD3Q9NY59 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMPD3Q9NY59 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMPD3Q9NY59 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMPD3Q9NY59 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMPD3Q9NY59 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMPD3Q9NY59 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMPD3Q9NY59 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMPD3Q9NY59 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMPD3Q9NY59 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMPD3Q9NY59 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMPD3Q9NY59 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMPD3Q9NY59 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMPD3Q9NY59 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMPD3Q9NY59 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SMPD3Q9NY59 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SMPD3Q9NY59 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SMPD3Q9NY59 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms