Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MS4A12Q9NXJ0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MS4A12Q9NXJ0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MS4A12Q9NXJ0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MS4A12Q9NXJ0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MS4A12Q9NXJ0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MS4A12Q9NXJ0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MS4A12Q9NXJ0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MS4A12Q9NXJ0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MS4A12Q9NXJ0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MS4A12Q9NXJ0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MS4A12Q9NXJ0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MS4A12Q9NXJ0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MS4A12Q9NXJ0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MS4A12Q9NXJ0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MS4A12Q9NXJ0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MS4A12Q9NXJ0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MS4A12Q9NXJ0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MS4A12Q9NXJ0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MS4A12Q9NXJ0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MS4A12Q9NXJ0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MS4A12Q9NXJ0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MS4A12Q9NXJ0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MS4A12Q9NXJ0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MS4A12Q9NXJ0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MS4A12Q9NXJ0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MS4A12Q9NXJ0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MS4A12Q9NXJ0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MS4A12Q9NXJ0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MS4A12Q9NXJ0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MS4A12Q9NXJ0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MS4A12Q9NXJ0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MS4A12Q9NXJ0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MS4A12Q9NXJ0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MS4A12Q9NXJ0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MS4A12Q9NXJ0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MS4A12Q9NXJ0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
MS4A12Q9NXJ0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MS4A12Q9NXJ0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MS4A12Q9NXJ0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MS4A12Q9NXJ0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MS4A12Q9NXJ0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MS4A12Q9NXJ0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MS4A12Q9NXJ0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MS4A12Q9NXJ0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
MS4A12Q9NXJ0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
MS4A12Q9NXJ0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MS4A12Q9NXJ0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MS4A12Q9NXJ0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MS4A12Q9NXJ0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MS4A12Q9NXJ0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MS4A12Q9NXJ0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MS4A12Q9NXJ0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
MS4A12Q9NXJ0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MS4A12Q9NXJ0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MS4A12Q9NXJ0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MS4A12Q9NXJ0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
MS4A12Q9NXJ0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MS4A12Q9NXJ0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MS4A12Q9NXJ0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MS4A12Q9NXJ0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MS4A12Q9NXJ0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MS4A12Q9NXJ0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MS4A12Q9NXJ0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MS4A12Q9NXJ0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MS4A12Q9NXJ0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MS4A12Q9NXJ0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MS4A12Q9NXJ0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MS4A12Q9NXJ0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
MS4A12Q9NXJ0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MS4A12Q9NXJ0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MS4A12Q9NXJ0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MS4A12Q9NXJ0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MS4A12Q9NXJ0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MS4A12Q9NXJ0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MS4A12Q9NXJ0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MS4A12Q9NXJ0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MS4A12Q9NXJ0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MS4A12Q9NXJ0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MS4A12Q9NXJ0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MS4A12Q9NXJ0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MS4A12Q9NXJ0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MS4A12Q9NXJ0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MS4A12Q9NXJ0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MS4A12Q9NXJ0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MS4A12Q9NXJ0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MS4A12Q9NXJ0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MS4A12Q9NXJ0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MS4A12Q9NXJ0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
MS4A12Q9NXJ0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MS4A12Q9NXJ0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MS4A12Q9NXJ0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MS4A12Q9NXJ0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MS4A12Q9NXJ0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MS4A12Q9NXJ0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MS4A12Q9NXJ0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MS4A12Q9NXJ0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MS4A12Q9NXJ0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MS4A12Q9NXJ0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MS4A12Q9NXJ0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms