Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWB7

IFT57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT57Q9NWB7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
IFT57Q9NWB7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
IFT57Q9NWB7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
IFT57Q9NWB7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
IFT57Q9NWB7 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
IFT57Q9NWB7 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
IFT57Q9NWB7 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
IFT57Q9NWB7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
IFT57Q9NWB7 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
IFT57Q9NWB7 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
IFT57Q9NWB7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
IFT57Q9NWB7 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
IFT57Q9NWB7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
IFT57Q9NWB7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
IFT57Q9NWB7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
IFT57Q9NWB7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
IFT57Q9NWB7 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
IFT57Q9NWB7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
IFT57Q9NWB7 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
IFT57Q9NWB7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
IFT57Q9NWB7 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
IFT57Q9NWB7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
IFT57Q9NWB7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
IFT57Q9NWB7 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
IFT57Q9NWB7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
IFT57Q9NWB7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
IFT57Q9NWB7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
IFT57Q9NWB7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
IFT57Q9NWB7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
IFT57Q9NWB7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
IFT57Q9NWB7 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
IFT57Q9NWB7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
IFT57Q9NWB7 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
IFT57Q9NWB7 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
IFT57Q9NWB7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
IFT57Q9NWB7 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
IFT57Q9NWB7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
IFT57Q9NWB7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
IFT57Q9NWB7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
IFT57Q9NWB7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
IFT57Q9NWB7 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
IFT57Q9NWB7 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
IFT57Q9NWB7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
IFT57Q9NWB7 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
IFT57Q9NWB7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
IFT57Q9NWB7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
IFT57Q9NWB7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
IFT57Q9NWB7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
IFT57Q9NWB7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
IFT57Q9NWB7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
IFT57Q9NWB7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
IFT57Q9NWB7 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
IFT57Q9NWB7 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
IFT57Q9NWB7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC27.57■■■□□ 2
IFT57Q9NWB7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
IFT57Q9NWB7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
IFT57Q9NWB7 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
IFT57Q9NWB7 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
IFT57Q9NWB7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IFT57Q9NWB7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IFT57Q9NWB7 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
IFT57Q9NWB7 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
IFT57Q9NWB7 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
IFT57Q9NWB7 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.56■■■□□ 2
IFT57Q9NWB7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
IFT57Q9NWB7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IFT57Q9NWB7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
IFT57Q9NWB7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
IFT57Q9NWB7 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC27.55■■■□□ 2
IFT57Q9NWB7 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
IFT57Q9NWB7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.55■■■□□ 2
IFT57Q9NWB7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
IFT57Q9NWB7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
IFT57Q9NWB7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
IFT57Q9NWB7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
IFT57Q9NWB7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
IFT57Q9NWB7 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
IFT57Q9NWB7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
IFT57Q9NWB7 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
IFT57Q9NWB7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
IFT57Q9NWB7 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
IFT57Q9NWB7 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
IFT57Q9NWB7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
IFT57Q9NWB7 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
IFT57Q9NWB7 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
IFT57Q9NWB7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
IFT57Q9NWB7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IFT57Q9NWB7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IFT57Q9NWB7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IFT57Q9NWB7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IFT57Q9NWB7 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IFT57Q9NWB7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
IFT57Q9NWB7 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
IFT57Q9NWB7 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
IFT57Q9NWB7 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IFT57Q9NWB7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IFT57Q9NWB7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IFT57Q9NWB7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
IFT57Q9NWB7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
IFT57Q9NWB7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms