Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms