Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC3

SLC38A7, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 7, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A7Q9NVC3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC38A7Q9NVC3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC38A7Q9NVC3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC38A7Q9NVC3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC38A7Q9NVC3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC38A7Q9NVC3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC38A7Q9NVC3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC38A7Q9NVC3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC38A7Q9NVC3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC38A7Q9NVC3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC38A7Q9NVC3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC38A7Q9NVC3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC38A7Q9NVC3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC38A7Q9NVC3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC38A7Q9NVC3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC38A7Q9NVC3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC38A7Q9NVC3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC38A7Q9NVC3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC38A7Q9NVC3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC38A7Q9NVC3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC38A7Q9NVC3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC38A7Q9NVC3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC38A7Q9NVC3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC38A7Q9NVC3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC38A7Q9NVC3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC38A7Q9NVC3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC38A7Q9NVC3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC38A7Q9NVC3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC38A7Q9NVC3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC38A7Q9NVC3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC38A7Q9NVC3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC38A7Q9NVC3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC38A7Q9NVC3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC38A7Q9NVC3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC38A7Q9NVC3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC38A7Q9NVC3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC38A7Q9NVC3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC38A7Q9NVC3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC38A7Q9NVC3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC38A7Q9NVC3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC38A7Q9NVC3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC38A7Q9NVC3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC38A7Q9NVC3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC38A7Q9NVC3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC38A7Q9NVC3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC38A7Q9NVC3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC38A7Q9NVC3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC38A7Q9NVC3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC38A7Q9NVC3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC38A7Q9NVC3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC38A7Q9NVC3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC38A7Q9NVC3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC38A7Q9NVC3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC38A7Q9NVC3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC38A7Q9NVC3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC38A7Q9NVC3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC38A7Q9NVC3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC38A7Q9NVC3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC38A7Q9NVC3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC38A7Q9NVC3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC38A7Q9NVC3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC38A7Q9NVC3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC38A7Q9NVC3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC38A7Q9NVC3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC38A7Q9NVC3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC38A7Q9NVC3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC38A7Q9NVC3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC38A7Q9NVC3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC38A7Q9NVC3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC38A7Q9NVC3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC38A7Q9NVC3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC38A7Q9NVC3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC38A7Q9NVC3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC38A7Q9NVC3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC38A7Q9NVC3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC38A7Q9NVC3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC38A7Q9NVC3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC38A7Q9NVC3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC38A7Q9NVC3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC38A7Q9NVC3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC38A7Q9NVC3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC38A7Q9NVC3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC38A7Q9NVC3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC38A7Q9NVC3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC38A7Q9NVC3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC38A7Q9NVC3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC38A7Q9NVC3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC38A7Q9NVC3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC38A7Q9NVC3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC38A7Q9NVC3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC38A7Q9NVC3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC38A7Q9NVC3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC38A7Q9NVC3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC38A7Q9NVC3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC38A7Q9NVC3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC38A7Q9NVC3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC38A7Q9NVC3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC38A7Q9NVC3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC38A7Q9NVC3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC38A7Q9NVC3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms