Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV12

TMEM140, Transmembrane protein 140, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM140Q9NV12 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms