Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUV7

SPTLC3, Serine palmitoyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC3Q9NUV7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPTLC3Q9NUV7 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPTLC3Q9NUV7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPTLC3Q9NUV7 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPTLC3Q9NUV7 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPTLC3Q9NUV7 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPTLC3Q9NUV7 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPTLC3Q9NUV7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPTLC3Q9NUV7 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPTLC3Q9NUV7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPTLC3Q9NUV7 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPTLC3Q9NUV7 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPTLC3Q9NUV7 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPTLC3Q9NUV7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPTLC3Q9NUV7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPTLC3Q9NUV7 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPTLC3Q9NUV7 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPTLC3Q9NUV7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPTLC3Q9NUV7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPTLC3Q9NUV7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPTLC3Q9NUV7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SPTLC3Q9NUV7 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPTLC3Q9NUV7 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPTLC3Q9NUV7 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPTLC3Q9NUV7 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPTLC3Q9NUV7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPTLC3Q9NUV7 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPTLC3Q9NUV7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPTLC3Q9NUV7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPTLC3Q9NUV7 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPTLC3Q9NUV7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SPTLC3Q9NUV7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SPTLC3Q9NUV7 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPTLC3Q9NUV7 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPTLC3Q9NUV7 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPTLC3Q9NUV7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPTLC3Q9NUV7 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPTLC3Q9NUV7 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPTLC3Q9NUV7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPTLC3Q9NUV7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPTLC3Q9NUV7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPTLC3Q9NUV7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPTLC3Q9NUV7 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPTLC3Q9NUV7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPTLC3Q9NUV7 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPTLC3Q9NUV7 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPTLC3Q9NUV7 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPTLC3Q9NUV7 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPTLC3Q9NUV7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPTLC3Q9NUV7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPTLC3Q9NUV7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPTLC3Q9NUV7 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPTLC3Q9NUV7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPTLC3Q9NUV7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SPTLC3Q9NUV7 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPTLC3Q9NUV7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPTLC3Q9NUV7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPTLC3Q9NUV7 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPTLC3Q9NUV7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPTLC3Q9NUV7 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPTLC3Q9NUV7 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPTLC3Q9NUV7 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPTLC3Q9NUV7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPTLC3Q9NUV7 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPTLC3Q9NUV7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPTLC3Q9NUV7 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPTLC3Q9NUV7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPTLC3Q9NUV7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPTLC3Q9NUV7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPTLC3Q9NUV7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPTLC3Q9NUV7 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPTLC3Q9NUV7 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPTLC3Q9NUV7 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPTLC3Q9NUV7 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPTLC3Q9NUV7 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPTLC3Q9NUV7 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPTLC3Q9NUV7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPTLC3Q9NUV7 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPTLC3Q9NUV7 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPTLC3Q9NUV7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPTLC3Q9NUV7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SPTLC3Q9NUV7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPTLC3Q9NUV7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPTLC3Q9NUV7 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPTLC3Q9NUV7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPTLC3Q9NUV7 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPTLC3Q9NUV7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPTLC3Q9NUV7 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPTLC3Q9NUV7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPTLC3Q9NUV7 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPTLC3Q9NUV7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPTLC3Q9NUV7 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPTLC3Q9NUV7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPTLC3Q9NUV7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPTLC3Q9NUV7 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPTLC3Q9NUV7 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPTLC3Q9NUV7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPTLC3Q9NUV7 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPTLC3Q9NUV7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPTLC3Q9NUV7 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms