Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMBRD1Q9NUN5 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMBRD1Q9NUN5 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMBRD1Q9NUN5 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMBRD1Q9NUN5 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMBRD1Q9NUN5 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMBRD1Q9NUN5 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMBRD1Q9NUN5 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LMBRD1Q9NUN5 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LMBRD1Q9NUN5 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LMBRD1Q9NUN5 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMBRD1Q9NUN5 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMBRD1Q9NUN5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LMBRD1Q9NUN5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMBRD1Q9NUN5 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMBRD1Q9NUN5 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMBRD1Q9NUN5 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMBRD1Q9NUN5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMBRD1Q9NUN5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMBRD1Q9NUN5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMBRD1Q9NUN5 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMBRD1Q9NUN5 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMBRD1Q9NUN5 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMBRD1Q9NUN5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LMBRD1Q9NUN5 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMBRD1Q9NUN5 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMBRD1Q9NUN5 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMBRD1Q9NUN5 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMBRD1Q9NUN5 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMBRD1Q9NUN5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMBRD1Q9NUN5 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMBRD1Q9NUN5 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMBRD1Q9NUN5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMBRD1Q9NUN5 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMBRD1Q9NUN5 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMBRD1Q9NUN5 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMBRD1Q9NUN5 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMBRD1Q9NUN5 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMBRD1Q9NUN5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMBRD1Q9NUN5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMBRD1Q9NUN5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMBRD1Q9NUN5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMBRD1Q9NUN5 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LMBRD1Q9NUN5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMBRD1Q9NUN5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMBRD1Q9NUN5 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMBRD1Q9NUN5 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMBRD1Q9NUN5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMBRD1Q9NUN5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMBRD1Q9NUN5 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMBRD1Q9NUN5 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMBRD1Q9NUN5 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMBRD1Q9NUN5 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMBRD1Q9NUN5 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMBRD1Q9NUN5 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMBRD1Q9NUN5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMBRD1Q9NUN5 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMBRD1Q9NUN5 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMBRD1Q9NUN5 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMBRD1Q9NUN5 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LMBRD1Q9NUN5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMBRD1Q9NUN5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMBRD1Q9NUN5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LMBRD1Q9NUN5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMBRD1Q9NUN5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMBRD1Q9NUN5 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMBRD1Q9NUN5 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMBRD1Q9NUN5 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMBRD1Q9NUN5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMBRD1Q9NUN5 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMBRD1Q9NUN5 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMBRD1Q9NUN5 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMBRD1Q9NUN5 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMBRD1Q9NUN5 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMBRD1Q9NUN5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMBRD1Q9NUN5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMBRD1Q9NUN5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMBRD1Q9NUN5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LMBRD1Q9NUN5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMBRD1Q9NUN5 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMBRD1Q9NUN5 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMBRD1Q9NUN5 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMBRD1Q9NUN5 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMBRD1Q9NUN5 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LMBRD1Q9NUN5 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LMBRD1Q9NUN5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMBRD1Q9NUN5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMBRD1Q9NUN5 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMBRD1Q9NUN5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMBRD1Q9NUN5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMBRD1Q9NUN5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMBRD1Q9NUN5 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMBRD1Q9NUN5 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMBRD1Q9NUN5 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMBRD1Q9NUN5 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMBRD1Q9NUN5 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LMBRD1Q9NUN5 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LMBRD1Q9NUN5 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LMBRD1Q9NUN5 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LMBRD1Q9NUN5 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms