Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS61

KCNIP2, Kv channel-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP2Q9NS61 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms