Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX3

NDUFA4L2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 4-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA4L2Q9NRX3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NDUFA4L2Q9NRX3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NDUFA4L2Q9NRX3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NDUFA4L2Q9NRX3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NDUFA4L2Q9NRX3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NDUFA4L2Q9NRX3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NDUFA4L2Q9NRX3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NDUFA4L2Q9NRX3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NDUFA4L2Q9NRX3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NDUFA4L2Q9NRX3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NDUFA4L2Q9NRX3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NDUFA4L2Q9NRX3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NDUFA4L2Q9NRX3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NDUFA4L2Q9NRX3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NDUFA4L2Q9NRX3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
NDUFA4L2Q9NRX3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
NDUFA4L2Q9NRX3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
NDUFA4L2Q9NRX3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
NDUFA4L2Q9NRX3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
NDUFA4L2Q9NRX3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NDUFA4L2Q9NRX3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NDUFA4L2Q9NRX3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NDUFA4L2Q9NRX3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NDUFA4L2Q9NRX3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NDUFA4L2Q9NRX3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NDUFA4L2Q9NRX3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NDUFA4L2Q9NRX3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NDUFA4L2Q9NRX3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NDUFA4L2Q9NRX3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NDUFA4L2Q9NRX3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NDUFA4L2Q9NRX3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NDUFA4L2Q9NRX3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NDUFA4L2Q9NRX3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NDUFA4L2Q9NRX3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NDUFA4L2Q9NRX3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NDUFA4L2Q9NRX3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDUFA4L2Q9NRX3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDUFA4L2Q9NRX3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDUFA4L2Q9NRX3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDUFA4L2Q9NRX3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDUFA4L2Q9NRX3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDUFA4L2Q9NRX3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDUFA4L2Q9NRX3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDUFA4L2Q9NRX3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDUFA4L2Q9NRX3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDUFA4L2Q9NRX3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDUFA4L2Q9NRX3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDUFA4L2Q9NRX3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDUFA4L2Q9NRX3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDUFA4L2Q9NRX3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDUFA4L2Q9NRX3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDUFA4L2Q9NRX3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDUFA4L2Q9NRX3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDUFA4L2Q9NRX3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDUFA4L2Q9NRX3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDUFA4L2Q9NRX3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDUFA4L2Q9NRX3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDUFA4L2Q9NRX3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDUFA4L2Q9NRX3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDUFA4L2Q9NRX3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDUFA4L2Q9NRX3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDUFA4L2Q9NRX3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDUFA4L2Q9NRX3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDUFA4L2Q9NRX3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NDUFA4L2Q9NRX3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDUFA4L2Q9NRX3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDUFA4L2Q9NRX3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDUFA4L2Q9NRX3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDUFA4L2Q9NRX3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDUFA4L2Q9NRX3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDUFA4L2Q9NRX3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDUFA4L2Q9NRX3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDUFA4L2Q9NRX3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDUFA4L2Q9NRX3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDUFA4L2Q9NRX3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDUFA4L2Q9NRX3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDUFA4L2Q9NRX3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDUFA4L2Q9NRX3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDUFA4L2Q9NRX3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDUFA4L2Q9NRX3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDUFA4L2Q9NRX3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDUFA4L2Q9NRX3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDUFA4L2Q9NRX3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDUFA4L2Q9NRX3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDUFA4L2Q9NRX3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDUFA4L2Q9NRX3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NDUFA4L2Q9NRX3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDUFA4L2Q9NRX3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDUFA4L2Q9NRX3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDUFA4L2Q9NRX3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDUFA4L2Q9NRX3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDUFA4L2Q9NRX3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDUFA4L2Q9NRX3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDUFA4L2Q9NRX3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDUFA4L2Q9NRX3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDUFA4L2Q9NRX3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDUFA4L2Q9NRX3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDUFA4L2Q9NRX3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDUFA4L2Q9NRX3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NDUFA4L2Q9NRX3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms