Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR96

TLR9, Toll-like receptor 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR9Q9NR96 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TLR9Q9NR96 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TLR9Q9NR96 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TLR9Q9NR96 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TLR9Q9NR96 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TLR9Q9NR96 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TLR9Q9NR96 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TLR9Q9NR96 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TLR9Q9NR96 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TLR9Q9NR96 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TLR9Q9NR96 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TLR9Q9NR96 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TLR9Q9NR96 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TLR9Q9NR96 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TLR9Q9NR96 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TLR9Q9NR96 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TLR9Q9NR96 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TLR9Q9NR96 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TLR9Q9NR96 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TLR9Q9NR96 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TLR9Q9NR96 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TLR9Q9NR96 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TLR9Q9NR96 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TLR9Q9NR96 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TLR9Q9NR96 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TLR9Q9NR96 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TLR9Q9NR96 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TLR9Q9NR96 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TLR9Q9NR96 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TLR9Q9NR96 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TLR9Q9NR96 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TLR9Q9NR96 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TLR9Q9NR96 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TLR9Q9NR96 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TLR9Q9NR96 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TLR9Q9NR96 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TLR9Q9NR96 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TLR9Q9NR96 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TLR9Q9NR96 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TLR9Q9NR96 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TLR9Q9NR96 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TLR9Q9NR96 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TLR9Q9NR96 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TLR9Q9NR96 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TLR9Q9NR96 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TLR9Q9NR96 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TLR9Q9NR96 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TLR9Q9NR96 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TLR9Q9NR96 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TLR9Q9NR96 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TLR9Q9NR96 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TLR9Q9NR96 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TLR9Q9NR96 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TLR9Q9NR96 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TLR9Q9NR96 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TLR9Q9NR96 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TLR9Q9NR96 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TLR9Q9NR96 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TLR9Q9NR96 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TLR9Q9NR96 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TLR9Q9NR96 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TLR9Q9NR96 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TLR9Q9NR96 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TLR9Q9NR96 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TLR9Q9NR96 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TLR9Q9NR96 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TLR9Q9NR96 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TLR9Q9NR96 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TLR9Q9NR96 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TLR9Q9NR96 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TLR9Q9NR96 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TLR9Q9NR96 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TLR9Q9NR96 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TLR9Q9NR96 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TLR9Q9NR96 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TLR9Q9NR96 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TLR9Q9NR96 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TLR9Q9NR96 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TLR9Q9NR96 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TLR9Q9NR96 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TLR9Q9NR96 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TLR9Q9NR96 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TLR9Q9NR96 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TLR9Q9NR96 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TLR9Q9NR96 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TLR9Q9NR96 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TLR9Q9NR96 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TLR9Q9NR96 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TLR9Q9NR96 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TLR9Q9NR96 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TLR9Q9NR96 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TLR9Q9NR96 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TLR9Q9NR96 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TLR9Q9NR96 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TLR9Q9NR96 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TLR9Q9NR96 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TLR9Q9NR96 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TLR9Q9NR96 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TLR9Q9NR96 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TLR9Q9NR96 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms