Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR23

GDF3, Growth/differentiation factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF3Q9NR23 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDF3Q9NR23 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDF3Q9NR23 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDF3Q9NR23 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDF3Q9NR23 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GDF3Q9NR23 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GDF3Q9NR23 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GDF3Q9NR23 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GDF3Q9NR23 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GDF3Q9NR23 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GDF3Q9NR23 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms