Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW8

CNGB3, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-3, humanhuman

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Length 809 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB3Q9NQW8 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNGB3Q9NQW8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNGB3Q9NQW8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CNGB3Q9NQW8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNGB3Q9NQW8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNGB3Q9NQW8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNGB3Q9NQW8 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNGB3Q9NQW8 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNGB3Q9NQW8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNGB3Q9NQW8 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CNGB3Q9NQW8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNGB3Q9NQW8 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNGB3Q9NQW8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNGB3Q9NQW8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CNGB3Q9NQW8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNGB3Q9NQW8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNGB3Q9NQW8 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNGB3Q9NQW8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNGB3Q9NQW8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNGB3Q9NQW8 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNGB3Q9NQW8 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNGB3Q9NQW8 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNGB3Q9NQW8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNGB3Q9NQW8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNGB3Q9NQW8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNGB3Q9NQW8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNGB3Q9NQW8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNGB3Q9NQW8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CNGB3Q9NQW8 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNGB3Q9NQW8 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNGB3Q9NQW8 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNGB3Q9NQW8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNGB3Q9NQW8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNGB3Q9NQW8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNGB3Q9NQW8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNGB3Q9NQW8 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGB3Q9NQW8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGB3Q9NQW8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGB3Q9NQW8 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGB3Q9NQW8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGB3Q9NQW8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGB3Q9NQW8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGB3Q9NQW8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGB3Q9NQW8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGB3Q9NQW8 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGB3Q9NQW8 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGB3Q9NQW8 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGB3Q9NQW8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGB3Q9NQW8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGB3Q9NQW8 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGB3Q9NQW8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGB3Q9NQW8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNGB3Q9NQW8 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNGB3Q9NQW8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNGB3Q9NQW8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNGB3Q9NQW8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNGB3Q9NQW8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNGB3Q9NQW8 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNGB3Q9NQW8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNGB3Q9NQW8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNGB3Q9NQW8 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNGB3Q9NQW8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNGB3Q9NQW8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CNGB3Q9NQW8 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNGB3Q9NQW8 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNGB3Q9NQW8 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNGB3Q9NQW8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNGB3Q9NQW8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNGB3Q9NQW8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNGB3Q9NQW8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNGB3Q9NQW8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNGB3Q9NQW8 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CNGB3Q9NQW8 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNGB3Q9NQW8 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNGB3Q9NQW8 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNGB3Q9NQW8 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNGB3Q9NQW8 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CNGB3Q9NQW8 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNGB3Q9NQW8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNGB3Q9NQW8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNGB3Q9NQW8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNGB3Q9NQW8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNGB3Q9NQW8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNGB3Q9NQW8 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNGB3Q9NQW8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNGB3Q9NQW8 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNGB3Q9NQW8 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNGB3Q9NQW8 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNGB3Q9NQW8 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNGB3Q9NQW8 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNGB3Q9NQW8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNGB3Q9NQW8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNGB3Q9NQW8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNGB3Q9NQW8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNGB3Q9NQW8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNGB3Q9NQW8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNGB3Q9NQW8 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNGB3Q9NQW8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNGB3Q9NQW8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNGB3Q9NQW8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
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