Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP80

PNPLA8, Calcium-independent phospholipase A2-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA8Q9NP80 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNPLA8Q9NP80 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNPLA8Q9NP80 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNPLA8Q9NP80 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNPLA8Q9NP80 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNPLA8Q9NP80 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNPLA8Q9NP80 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNPLA8Q9NP80 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNPLA8Q9NP80 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNPLA8Q9NP80 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNPLA8Q9NP80 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNPLA8Q9NP80 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNPLA8Q9NP80 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNPLA8Q9NP80 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNPLA8Q9NP80 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNPLA8Q9NP80 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNPLA8Q9NP80 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNPLA8Q9NP80 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNPLA8Q9NP80 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PNPLA8Q9NP80 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PNPLA8Q9NP80 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PNPLA8Q9NP80 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PNPLA8Q9NP80 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PNPLA8Q9NP80 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PNPLA8Q9NP80 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PNPLA8Q9NP80 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PNPLA8Q9NP80 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PNPLA8Q9NP80 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PNPLA8Q9NP80 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PNPLA8Q9NP80 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PNPLA8Q9NP80 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PNPLA8Q9NP80 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PNPLA8Q9NP80 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PNPLA8Q9NP80 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PNPLA8Q9NP80 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PNPLA8Q9NP80 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PNPLA8Q9NP80 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PNPLA8Q9NP80 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PNPLA8Q9NP80 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PNPLA8Q9NP80 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PNPLA8Q9NP80 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PNPLA8Q9NP80 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PNPLA8Q9NP80 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PNPLA8Q9NP80 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PNPLA8Q9NP80 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PNPLA8Q9NP80 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PNPLA8Q9NP80 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PNPLA8Q9NP80 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PNPLA8Q9NP80 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PNPLA8Q9NP80 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PNPLA8Q9NP80 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PNPLA8Q9NP80 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNPLA8Q9NP80 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNPLA8Q9NP80 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNPLA8Q9NP80 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNPLA8Q9NP80 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNPLA8Q9NP80 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNPLA8Q9NP80 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNPLA8Q9NP80 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNPLA8Q9NP80 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNPLA8Q9NP80 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PNPLA8Q9NP80 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNPLA8Q9NP80 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PNPLA8Q9NP80 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNPLA8Q9NP80 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNPLA8Q9NP80 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNPLA8Q9NP80 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNPLA8Q9NP80 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNPLA8Q9NP80 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNPLA8Q9NP80 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PNPLA8Q9NP80 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNPLA8Q9NP80 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNPLA8Q9NP80 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNPLA8Q9NP80 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNPLA8Q9NP80 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNPLA8Q9NP80 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNPLA8Q9NP80 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNPLA8Q9NP80 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNPLA8Q9NP80 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNPLA8Q9NP80 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNPLA8Q9NP80 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNPLA8Q9NP80 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNPLA8Q9NP80 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNPLA8Q9NP80 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNPLA8Q9NP80 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNPLA8Q9NP80 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PNPLA8Q9NP80 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNPLA8Q9NP80 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNPLA8Q9NP80 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNPLA8Q9NP80 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNPLA8Q9NP80 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNPLA8Q9NP80 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNPLA8Q9NP80 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNPLA8Q9NP80 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNPLA8Q9NP80 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNPLA8Q9NP80 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNPLA8Q9NP80 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PNPLA8Q9NP80 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNPLA8Q9NP80 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNPLA8Q9NP80 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms