Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU9

BRMS1, Breast cancer metastasis-suppressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1Q9HCU9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRMS1Q9HCU9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRMS1Q9HCU9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRMS1Q9HCU9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRMS1Q9HCU9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRMS1Q9HCU9 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRMS1Q9HCU9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRMS1Q9HCU9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRMS1Q9HCU9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRMS1Q9HCU9 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRMS1Q9HCU9 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRMS1Q9HCU9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRMS1Q9HCU9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRMS1Q9HCU9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRMS1Q9HCU9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRMS1Q9HCU9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRMS1Q9HCU9 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRMS1Q9HCU9 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRMS1Q9HCU9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRMS1Q9HCU9 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRMS1Q9HCU9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
BRMS1Q9HCU9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRMS1Q9HCU9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRMS1Q9HCU9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRMS1Q9HCU9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRMS1Q9HCU9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRMS1Q9HCU9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRMS1Q9HCU9 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRMS1Q9HCU9 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRMS1Q9HCU9 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRMS1Q9HCU9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRMS1Q9HCU9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRMS1Q9HCU9 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRMS1Q9HCU9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRMS1Q9HCU9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRMS1Q9HCU9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRMS1Q9HCU9 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRMS1Q9HCU9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRMS1Q9HCU9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRMS1Q9HCU9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRMS1Q9HCU9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRMS1Q9HCU9 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
BRMS1Q9HCU9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRMS1Q9HCU9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
BRMS1Q9HCU9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRMS1Q9HCU9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRMS1Q9HCU9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRMS1Q9HCU9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRMS1Q9HCU9 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRMS1Q9HCU9 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRMS1Q9HCU9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRMS1Q9HCU9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRMS1Q9HCU9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRMS1Q9HCU9 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRMS1Q9HCU9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRMS1Q9HCU9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRMS1Q9HCU9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRMS1Q9HCU9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRMS1Q9HCU9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRMS1Q9HCU9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRMS1Q9HCU9 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
BRMS1Q9HCU9 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRMS1Q9HCU9 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRMS1Q9HCU9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRMS1Q9HCU9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRMS1Q9HCU9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRMS1Q9HCU9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRMS1Q9HCU9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRMS1Q9HCU9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRMS1Q9HCU9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
BRMS1Q9HCU9 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRMS1Q9HCU9 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRMS1Q9HCU9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRMS1Q9HCU9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRMS1Q9HCU9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRMS1Q9HCU9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRMS1Q9HCU9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRMS1Q9HCU9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRMS1Q9HCU9 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRMS1Q9HCU9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRMS1Q9HCU9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRMS1Q9HCU9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRMS1Q9HCU9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRMS1Q9HCU9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRMS1Q9HCU9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
BRMS1Q9HCU9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRMS1Q9HCU9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRMS1Q9HCU9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRMS1Q9HCU9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRMS1Q9HCU9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRMS1Q9HCU9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
BRMS1Q9HCU9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRMS1Q9HCU9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRMS1Q9HCU9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRMS1Q9HCU9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRMS1Q9HCU9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRMS1Q9HCU9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRMS1Q9HCU9 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRMS1Q9HCU9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRMS1Q9HCU9 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms