Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9D4

ZNF408, Zinc finger protein 408, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF408Q9H9D4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF408Q9H9D4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF408Q9H9D4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF408Q9H9D4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF408Q9H9D4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF408Q9H9D4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF408Q9H9D4 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF408Q9H9D4 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF408Q9H9D4 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF408Q9H9D4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF408Q9H9D4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF408Q9H9D4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF408Q9H9D4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF408Q9H9D4 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF408Q9H9D4 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF408Q9H9D4 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF408Q9H9D4 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF408Q9H9D4 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF408Q9H9D4 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF408Q9H9D4 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF408Q9H9D4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF408Q9H9D4 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF408Q9H9D4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF408Q9H9D4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF408Q9H9D4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF408Q9H9D4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF408Q9H9D4 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF408Q9H9D4 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF408Q9H9D4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF408Q9H9D4 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF408Q9H9D4 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF408Q9H9D4 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF408Q9H9D4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF408Q9H9D4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF408Q9H9D4 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF408Q9H9D4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF408Q9H9D4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF408Q9H9D4 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF408Q9H9D4 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF408Q9H9D4 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF408Q9H9D4 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF408Q9H9D4 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF408Q9H9D4 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF408Q9H9D4 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF408Q9H9D4 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF408Q9H9D4 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF408Q9H9D4 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF408Q9H9D4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF408Q9H9D4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF408Q9H9D4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ZNF408Q9H9D4 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF408Q9H9D4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF408Q9H9D4 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF408Q9H9D4 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF408Q9H9D4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF408Q9H9D4 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF408Q9H9D4 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF408Q9H9D4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF408Q9H9D4 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF408Q9H9D4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF408Q9H9D4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF408Q9H9D4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF408Q9H9D4 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF408Q9H9D4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF408Q9H9D4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF408Q9H9D4 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF408Q9H9D4 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF408Q9H9D4 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF408Q9H9D4 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF408Q9H9D4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF408Q9H9D4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF408Q9H9D4 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF408Q9H9D4 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF408Q9H9D4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF408Q9H9D4 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF408Q9H9D4 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF408Q9H9D4 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF408Q9H9D4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF408Q9H9D4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF408Q9H9D4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF408Q9H9D4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF408Q9H9D4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF408Q9H9D4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF408Q9H9D4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF408Q9H9D4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF408Q9H9D4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF408Q9H9D4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF408Q9H9D4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF408Q9H9D4 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF408Q9H9D4 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF408Q9H9D4 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF408Q9H9D4 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF408Q9H9D4 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF408Q9H9D4 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF408Q9H9D4 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF408Q9H9D4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF408Q9H9D4 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF408Q9H9D4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF408Q9H9D4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF408Q9H9D4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms