Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0U4

RAB1B, Ras-related protein Rab-1B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1BQ9H0U4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB1BQ9H0U4 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB1BQ9H0U4 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB1BQ9H0U4 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB1BQ9H0U4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB1BQ9H0U4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB1BQ9H0U4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB1BQ9H0U4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB1BQ9H0U4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB1BQ9H0U4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB1BQ9H0U4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB1BQ9H0U4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB1BQ9H0U4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB1BQ9H0U4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB1BQ9H0U4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB1BQ9H0U4 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB1BQ9H0U4 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB1BQ9H0U4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB1BQ9H0U4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB1BQ9H0U4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB1BQ9H0U4 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB1BQ9H0U4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB1BQ9H0U4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB1BQ9H0U4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB1BQ9H0U4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB1BQ9H0U4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB1BQ9H0U4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB1BQ9H0U4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB1BQ9H0U4 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB1BQ9H0U4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB1BQ9H0U4 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB1BQ9H0U4 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB1BQ9H0U4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB1BQ9H0U4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB1BQ9H0U4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB1BQ9H0U4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB1BQ9H0U4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB1BQ9H0U4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB1BQ9H0U4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB1BQ9H0U4 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB1BQ9H0U4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB1BQ9H0U4 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB1BQ9H0U4 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RAB1BQ9H0U4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB1BQ9H0U4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB1BQ9H0U4 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB1BQ9H0U4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB1BQ9H0U4 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB1BQ9H0U4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB1BQ9H0U4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB1BQ9H0U4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB1BQ9H0U4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB1BQ9H0U4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB1BQ9H0U4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB1BQ9H0U4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB1BQ9H0U4 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB1BQ9H0U4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB1BQ9H0U4 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB1BQ9H0U4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB1BQ9H0U4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB1BQ9H0U4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB1BQ9H0U4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB1BQ9H0U4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB1BQ9H0U4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB1BQ9H0U4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB1BQ9H0U4 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB1BQ9H0U4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB1BQ9H0U4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB1BQ9H0U4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB1BQ9H0U4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB1BQ9H0U4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB1BQ9H0U4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB1BQ9H0U4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB1BQ9H0U4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB1BQ9H0U4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB1BQ9H0U4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB1BQ9H0U4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB1BQ9H0U4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB1BQ9H0U4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB1BQ9H0U4 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB1BQ9H0U4 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB1BQ9H0U4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB1BQ9H0U4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB1BQ9H0U4 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB1BQ9H0U4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB1BQ9H0U4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB1BQ9H0U4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB1BQ9H0U4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB1BQ9H0U4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB1BQ9H0U4 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB1BQ9H0U4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB1BQ9H0U4 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB1BQ9H0U4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB1BQ9H0U4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB1BQ9H0U4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB1BQ9H0U4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB1BQ9H0U4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB1BQ9H0U4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB1BQ9H0U4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB1BQ9H0U4 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms