Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0I3

CCDC113, Coiled-coil domain-containing protein 113, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC113Q9H0I3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC113Q9H0I3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC113Q9H0I3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC113Q9H0I3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC113Q9H0I3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC113Q9H0I3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC113Q9H0I3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC113Q9H0I3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC113Q9H0I3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC113Q9H0I3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC113Q9H0I3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC113Q9H0I3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC113Q9H0I3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC113Q9H0I3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC113Q9H0I3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC113Q9H0I3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC113Q9H0I3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC113Q9H0I3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC113Q9H0I3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC113Q9H0I3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC113Q9H0I3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC113Q9H0I3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC113Q9H0I3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC113Q9H0I3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC113Q9H0I3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC113Q9H0I3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC113Q9H0I3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC113Q9H0I3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC113Q9H0I3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC113Q9H0I3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC113Q9H0I3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC113Q9H0I3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC113Q9H0I3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC113Q9H0I3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC113Q9H0I3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC113Q9H0I3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC113Q9H0I3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC113Q9H0I3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC113Q9H0I3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC113Q9H0I3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC113Q9H0I3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC113Q9H0I3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC113Q9H0I3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC113Q9H0I3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC113Q9H0I3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC113Q9H0I3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC113Q9H0I3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC113Q9H0I3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC113Q9H0I3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC113Q9H0I3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC113Q9H0I3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC113Q9H0I3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC113Q9H0I3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC113Q9H0I3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC113Q9H0I3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC113Q9H0I3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC113Q9H0I3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC113Q9H0I3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC113Q9H0I3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC113Q9H0I3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC113Q9H0I3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC113Q9H0I3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC113Q9H0I3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC113Q9H0I3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC113Q9H0I3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC113Q9H0I3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC113Q9H0I3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC113Q9H0I3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC113Q9H0I3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC113Q9H0I3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC113Q9H0I3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC113Q9H0I3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC113Q9H0I3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC113Q9H0I3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC113Q9H0I3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC113Q9H0I3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC113Q9H0I3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC113Q9H0I3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC113Q9H0I3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC113Q9H0I3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC113Q9H0I3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC113Q9H0I3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC113Q9H0I3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC113Q9H0I3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC113Q9H0I3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC113Q9H0I3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC113Q9H0I3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC113Q9H0I3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC113Q9H0I3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC113Q9H0I3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC113Q9H0I3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC113Q9H0I3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC113Q9H0I3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC113Q9H0I3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC113Q9H0I3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC113Q9H0I3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC113Q9H0I3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC113Q9H0I3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC113Q9H0I3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC113Q9H0I3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms