Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CNTNAP4Q9C0A0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CNTNAP4Q9C0A0 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CNTNAP4Q9C0A0 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CNTNAP4Q9C0A0 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CNTNAP4Q9C0A0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CNTNAP4Q9C0A0 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CNTNAP4Q9C0A0 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CNTNAP4Q9C0A0 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CNTNAP4Q9C0A0 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
CNTNAP4Q9C0A0 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
CNTNAP4Q9C0A0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNTNAP4Q9C0A0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNTNAP4Q9C0A0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNTNAP4Q9C0A0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNTNAP4Q9C0A0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNTNAP4Q9C0A0 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNTNAP4Q9C0A0 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNTNAP4Q9C0A0 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNTNAP4Q9C0A0 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNTNAP4Q9C0A0 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CNTNAP4Q9C0A0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CNTNAP4Q9C0A0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CNTNAP4Q9C0A0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CNTNAP4Q9C0A0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CNTNAP4Q9C0A0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CNTNAP4Q9C0A0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CNTNAP4Q9C0A0 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CNTNAP4Q9C0A0 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CNTNAP4Q9C0A0 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CNTNAP4Q9C0A0 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CNTNAP4Q9C0A0 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CNTNAP4Q9C0A0 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CNTNAP4Q9C0A0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CNTNAP4Q9C0A0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNTNAP4Q9C0A0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNTNAP4Q9C0A0 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNTNAP4Q9C0A0 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNTNAP4Q9C0A0 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CNTNAP4Q9C0A0 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNTNAP4Q9C0A0 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNTNAP4Q9C0A0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNTNAP4Q9C0A0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNTNAP4Q9C0A0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNTNAP4Q9C0A0 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNTNAP4Q9C0A0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNTNAP4Q9C0A0 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNTNAP4Q9C0A0 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNTNAP4Q9C0A0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNTNAP4Q9C0A0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNTNAP4Q9C0A0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNTNAP4Q9C0A0 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNTNAP4Q9C0A0 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNTNAP4Q9C0A0 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNTNAP4Q9C0A0 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNTNAP4Q9C0A0 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNTNAP4Q9C0A0 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNTNAP4Q9C0A0 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNTNAP4Q9C0A0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNTNAP4Q9C0A0 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNTNAP4Q9C0A0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNTNAP4Q9C0A0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNTNAP4Q9C0A0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNTNAP4Q9C0A0 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNTNAP4Q9C0A0 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNTNAP4Q9C0A0 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNTNAP4Q9C0A0 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNTNAP4Q9C0A0 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNTNAP4Q9C0A0 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNTNAP4Q9C0A0 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNTNAP4Q9C0A0 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNTNAP4Q9C0A0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CNTNAP4Q9C0A0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CNTNAP4Q9C0A0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CNTNAP4Q9C0A0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CNTNAP4Q9C0A0 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CNTNAP4Q9C0A0 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CNTNAP4Q9C0A0 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CNTNAP4Q9C0A0 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CNTNAP4Q9C0A0 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CNTNAP4Q9C0A0 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CNTNAP4Q9C0A0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CNTNAP4Q9C0A0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CNTNAP4Q9C0A0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CNTNAP4Q9C0A0 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CNTNAP4Q9C0A0 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CNTNAP4Q9C0A0 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CNTNAP4Q9C0A0 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CNTNAP4Q9C0A0 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CNTNAP4Q9C0A0 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CNTNAP4Q9C0A0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CNTNAP4Q9C0A0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CNTNAP4Q9C0A0 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CNTNAP4Q9C0A0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CNTNAP4Q9C0A0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNTNAP4Q9C0A0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNTNAP4Q9C0A0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNTNAP4Q9C0A0 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNTNAP4Q9C0A0 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms