Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BCO2Q9BYV7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCO2Q9BYV7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCO2Q9BYV7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCO2Q9BYV7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCO2Q9BYV7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCO2Q9BYV7 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCO2Q9BYV7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCO2Q9BYV7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCO2Q9BYV7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCO2Q9BYV7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCO2Q9BYV7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCO2Q9BYV7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCO2Q9BYV7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCO2Q9BYV7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCO2Q9BYV7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
BCO2Q9BYV7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCO2Q9BYV7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCO2Q9BYV7 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCO2Q9BYV7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCO2Q9BYV7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCO2Q9BYV7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCO2Q9BYV7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
BCO2Q9BYV7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCO2Q9BYV7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCO2Q9BYV7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCO2Q9BYV7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCO2Q9BYV7 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BCO2Q9BYV7 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCO2Q9BYV7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCO2Q9BYV7 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCO2Q9BYV7 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCO2Q9BYV7 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BCO2Q9BYV7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCO2Q9BYV7 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCO2Q9BYV7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCO2Q9BYV7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCO2Q9BYV7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCO2Q9BYV7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCO2Q9BYV7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCO2Q9BYV7 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCO2Q9BYV7 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCO2Q9BYV7 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCO2Q9BYV7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCO2Q9BYV7 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCO2Q9BYV7 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
BCO2Q9BYV7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCO2Q9BYV7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCO2Q9BYV7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCO2Q9BYV7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCO2Q9BYV7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCO2Q9BYV7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCO2Q9BYV7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCO2Q9BYV7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCO2Q9BYV7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCO2Q9BYV7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCO2Q9BYV7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCO2Q9BYV7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCO2Q9BYV7 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCO2Q9BYV7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCO2Q9BYV7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCO2Q9BYV7 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCO2Q9BYV7 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCO2Q9BYV7 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCO2Q9BYV7 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCO2Q9BYV7 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCO2Q9BYV7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCO2Q9BYV7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCO2Q9BYV7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCO2Q9BYV7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCO2Q9BYV7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCO2Q9BYV7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCO2Q9BYV7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCO2Q9BYV7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCO2Q9BYV7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCO2Q9BYV7 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCO2Q9BYV7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCO2Q9BYV7 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCO2Q9BYV7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCO2Q9BYV7 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCO2Q9BYV7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCO2Q9BYV7 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCO2Q9BYV7 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BCO2Q9BYV7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCO2Q9BYV7 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BCO2Q9BYV7 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BCO2Q9BYV7 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCO2Q9BYV7 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCO2Q9BYV7 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCO2Q9BYV7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCO2Q9BYV7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCO2Q9BYV7 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCO2Q9BYV7 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCO2Q9BYV7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCO2Q9BYV7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCO2Q9BYV7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCO2Q9BYV7 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCO2Q9BYV7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCO2Q9BYV7 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCO2Q9BYV7 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms