Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYB0

SHANK3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK3Q9BYB0 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SHANK3Q9BYB0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SHANK3Q9BYB0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SHANK3Q9BYB0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SHANK3Q9BYB0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SHANK3Q9BYB0 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SHANK3Q9BYB0 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SHANK3Q9BYB0 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SHANK3Q9BYB0 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SHANK3Q9BYB0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SHANK3Q9BYB0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SHANK3Q9BYB0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SHANK3Q9BYB0 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SHANK3Q9BYB0 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SHANK3Q9BYB0 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SHANK3Q9BYB0 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SHANK3Q9BYB0 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SHANK3Q9BYB0 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SHANK3Q9BYB0 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SHANK3Q9BYB0 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SHANK3Q9BYB0 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SHANK3Q9BYB0 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SHANK3Q9BYB0 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SHANK3Q9BYB0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SHANK3Q9BYB0 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SHANK3Q9BYB0 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SHANK3Q9BYB0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SHANK3Q9BYB0 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SHANK3Q9BYB0 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SHANK3Q9BYB0 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SHANK3Q9BYB0 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SHANK3Q9BYB0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SHANK3Q9BYB0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SHANK3Q9BYB0 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SHANK3Q9BYB0 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SHANK3Q9BYB0 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SHANK3Q9BYB0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SHANK3Q9BYB0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SHANK3Q9BYB0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SHANK3Q9BYB0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SHANK3Q9BYB0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SHANK3Q9BYB0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SHANK3Q9BYB0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SHANK3Q9BYB0 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SHANK3Q9BYB0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SHANK3Q9BYB0 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SHANK3Q9BYB0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SHANK3Q9BYB0 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SHANK3Q9BYB0 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SHANK3Q9BYB0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SHANK3Q9BYB0 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SHANK3Q9BYB0 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SHANK3Q9BYB0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SHANK3Q9BYB0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SHANK3Q9BYB0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SHANK3Q9BYB0 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SHANK3Q9BYB0 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SHANK3Q9BYB0 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SHANK3Q9BYB0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SHANK3Q9BYB0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SHANK3Q9BYB0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SHANK3Q9BYB0 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SHANK3Q9BYB0 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SHANK3Q9BYB0 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SHANK3Q9BYB0 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SHANK3Q9BYB0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SHANK3Q9BYB0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SHANK3Q9BYB0 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SHANK3Q9BYB0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SHANK3Q9BYB0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SHANK3Q9BYB0 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SHANK3Q9BYB0 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SHANK3Q9BYB0 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SHANK3Q9BYB0 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SHANK3Q9BYB0 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SHANK3Q9BYB0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SHANK3Q9BYB0 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SHANK3Q9BYB0 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SHANK3Q9BYB0 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SHANK3Q9BYB0 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SHANK3Q9BYB0 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SHANK3Q9BYB0 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SHANK3Q9BYB0 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SHANK3Q9BYB0 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SHANK3Q9BYB0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SHANK3Q9BYB0 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SHANK3Q9BYB0 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SHANK3Q9BYB0 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SHANK3Q9BYB0 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SHANK3Q9BYB0 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SHANK3Q9BYB0 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SHANK3Q9BYB0 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SHANK3Q9BYB0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SHANK3Q9BYB0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SHANK3Q9BYB0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SHANK3Q9BYB0 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SHANK3Q9BYB0 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SHANK3Q9BYB0 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SHANK3Q9BYB0 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SHANK3Q9BYB0 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms