Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VN1R3Q9BXE9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VN1R3Q9BXE9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VN1R3Q9BXE9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VN1R3Q9BXE9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VN1R3Q9BXE9 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VN1R3Q9BXE9 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VN1R3Q9BXE9 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VN1R3Q9BXE9 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
VN1R3Q9BXE9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VN1R3Q9BXE9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VN1R3Q9BXE9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VN1R3Q9BXE9 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
VN1R3Q9BXE9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VN1R3Q9BXE9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VN1R3Q9BXE9 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VN1R3Q9BXE9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VN1R3Q9BXE9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VN1R3Q9BXE9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VN1R3Q9BXE9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VN1R3Q9BXE9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VN1R3Q9BXE9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VN1R3Q9BXE9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VN1R3Q9BXE9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VN1R3Q9BXE9 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VN1R3Q9BXE9 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VN1R3Q9BXE9 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
VN1R3Q9BXE9 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VN1R3Q9BXE9 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VN1R3Q9BXE9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VN1R3Q9BXE9 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VN1R3Q9BXE9 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
VN1R3Q9BXE9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VN1R3Q9BXE9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VN1R3Q9BXE9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VN1R3Q9BXE9 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VN1R3Q9BXE9 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VN1R3Q9BXE9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VN1R3Q9BXE9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VN1R3Q9BXE9 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VN1R3Q9BXE9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VN1R3Q9BXE9 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VN1R3Q9BXE9 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VN1R3Q9BXE9 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VN1R3Q9BXE9 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VN1R3Q9BXE9 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VN1R3Q9BXE9 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VN1R3Q9BXE9 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
VN1R3Q9BXE9 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VN1R3Q9BXE9 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VN1R3Q9BXE9 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VN1R3Q9BXE9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VN1R3Q9BXE9 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VN1R3Q9BXE9 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VN1R3Q9BXE9 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VN1R3Q9BXE9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VN1R3Q9BXE9 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VN1R3Q9BXE9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VN1R3Q9BXE9 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VN1R3Q9BXE9 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VN1R3Q9BXE9 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VN1R3Q9BXE9 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VN1R3Q9BXE9 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VN1R3Q9BXE9 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VN1R3Q9BXE9 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VN1R3Q9BXE9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VN1R3Q9BXE9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VN1R3Q9BXE9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VN1R3Q9BXE9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VN1R3Q9BXE9 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VN1R3Q9BXE9 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VN1R3Q9BXE9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VN1R3Q9BXE9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VN1R3Q9BXE9 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VN1R3Q9BXE9 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VN1R3Q9BXE9 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VN1R3Q9BXE9 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
VN1R3Q9BXE9 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VN1R3Q9BXE9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VN1R3Q9BXE9 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
VN1R3Q9BXE9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
VN1R3Q9BXE9 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
VN1R3Q9BXE9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VN1R3Q9BXE9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VN1R3Q9BXE9 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VN1R3Q9BXE9 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VN1R3Q9BXE9 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
VN1R3Q9BXE9 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
VN1R3Q9BXE9 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VN1R3Q9BXE9 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VN1R3Q9BXE9 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VN1R3Q9BXE9 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VN1R3Q9BXE9 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VN1R3Q9BXE9 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VN1R3Q9BXE9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VN1R3Q9BXE9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VN1R3Q9BXE9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VN1R3Q9BXE9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VN1R3Q9BXE9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VN1R3Q9BXE9 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms