Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BBS2Q9BXC9 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
BBS2Q9BXC9 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
BBS2Q9BXC9 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BBS2Q9BXC9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
BBS2Q9BXC9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BBS2Q9BXC9 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BBS2Q9BXC9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BBS2Q9BXC9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BBS2Q9BXC9 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BBS2Q9BXC9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BBS2Q9BXC9 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BBS2Q9BXC9 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BBS2Q9BXC9 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BBS2Q9BXC9 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BBS2Q9BXC9 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BBS2Q9BXC9 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
BBS2Q9BXC9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
BBS2Q9BXC9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BBS2Q9BXC9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BBS2Q9BXC9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BBS2Q9BXC9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BBS2Q9BXC9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BBS2Q9BXC9 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BBS2Q9BXC9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BBS2Q9BXC9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BBS2Q9BXC9 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BBS2Q9BXC9 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BBS2Q9BXC9 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BBS2Q9BXC9 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BBS2Q9BXC9 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BBS2Q9BXC9 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BBS2Q9BXC9 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BBS2Q9BXC9 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BBS2Q9BXC9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BBS2Q9BXC9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BBS2Q9BXC9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BBS2Q9BXC9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BBS2Q9BXC9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BBS2Q9BXC9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BBS2Q9BXC9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BBS2Q9BXC9 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BBS2Q9BXC9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BBS2Q9BXC9 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BBS2Q9BXC9 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BBS2Q9BXC9 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BBS2Q9BXC9 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BBS2Q9BXC9 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
BBS2Q9BXC9 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BBS2Q9BXC9 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BBS2Q9BXC9 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BBS2Q9BXC9 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BBS2Q9BXC9 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BBS2Q9BXC9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BBS2Q9BXC9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BBS2Q9BXC9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BBS2Q9BXC9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BBS2Q9BXC9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BBS2Q9BXC9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BBS2Q9BXC9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BBS2Q9BXC9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BBS2Q9BXC9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BBS2Q9BXC9 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
BBS2Q9BXC9 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
BBS2Q9BXC9 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
BBS2Q9BXC9 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
BBS2Q9BXC9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BBS2Q9BXC9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BBS2Q9BXC9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BBS2Q9BXC9 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BBS2Q9BXC9 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BBS2Q9BXC9 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BBS2Q9BXC9 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BBS2Q9BXC9 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BBS2Q9BXC9 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BBS2Q9BXC9 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BBS2Q9BXC9 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BBS2Q9BXC9 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BBS2Q9BXC9 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BBS2Q9BXC9 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BBS2Q9BXC9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BBS2Q9BXC9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BBS2Q9BXC9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BBS2Q9BXC9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BBS2Q9BXC9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BBS2Q9BXC9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BBS2Q9BXC9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BBS2Q9BXC9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BBS2Q9BXC9 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BBS2Q9BXC9 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BBS2Q9BXC9 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BBS2Q9BXC9 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BBS2Q9BXC9 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BBS2Q9BXC9 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BBS2Q9BXC9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BBS2Q9BXC9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BBS2Q9BXC9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
BBS2Q9BXC9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
BBS2Q9BXC9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
BBS2Q9BXC9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms