Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX40

LSM14B, Protein LSM14 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM14BQ9BX40 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LSM14BQ9BX40 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LSM14BQ9BX40 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LSM14BQ9BX40 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LSM14BQ9BX40 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LSM14BQ9BX40 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LSM14BQ9BX40 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LSM14BQ9BX40 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LSM14BQ9BX40 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LSM14BQ9BX40 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LSM14BQ9BX40 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LSM14BQ9BX40 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LSM14BQ9BX40 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LSM14BQ9BX40 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LSM14BQ9BX40 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LSM14BQ9BX40 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LSM14BQ9BX40 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LSM14BQ9BX40 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LSM14BQ9BX40 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LSM14BQ9BX40 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LSM14BQ9BX40 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LSM14BQ9BX40 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LSM14BQ9BX40 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LSM14BQ9BX40 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LSM14BQ9BX40 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LSM14BQ9BX40 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LSM14BQ9BX40 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LSM14BQ9BX40 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LSM14BQ9BX40 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LSM14BQ9BX40 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LSM14BQ9BX40 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LSM14BQ9BX40 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LSM14BQ9BX40 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LSM14BQ9BX40 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LSM14BQ9BX40 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LSM14BQ9BX40 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LSM14BQ9BX40 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LSM14BQ9BX40 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LSM14BQ9BX40 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LSM14BQ9BX40 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LSM14BQ9BX40 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LSM14BQ9BX40 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LSM14BQ9BX40 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LSM14BQ9BX40 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LSM14BQ9BX40 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LSM14BQ9BX40 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LSM14BQ9BX40 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LSM14BQ9BX40 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LSM14BQ9BX40 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LSM14BQ9BX40 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LSM14BQ9BX40 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LSM14BQ9BX40 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LSM14BQ9BX40 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LSM14BQ9BX40 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LSM14BQ9BX40 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LSM14BQ9BX40 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LSM14BQ9BX40 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LSM14BQ9BX40 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LSM14BQ9BX40 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LSM14BQ9BX40 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LSM14BQ9BX40 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LSM14BQ9BX40 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LSM14BQ9BX40 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LSM14BQ9BX40 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LSM14BQ9BX40 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LSM14BQ9BX40 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LSM14BQ9BX40 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LSM14BQ9BX40 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LSM14BQ9BX40 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LSM14BQ9BX40 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LSM14BQ9BX40 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LSM14BQ9BX40 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LSM14BQ9BX40 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LSM14BQ9BX40 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LSM14BQ9BX40 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LSM14BQ9BX40 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LSM14BQ9BX40 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LSM14BQ9BX40 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LSM14BQ9BX40 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LSM14BQ9BX40 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LSM14BQ9BX40 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LSM14BQ9BX40 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LSM14BQ9BX40 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LSM14BQ9BX40 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LSM14BQ9BX40 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LSM14BQ9BX40 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LSM14BQ9BX40 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LSM14BQ9BX40 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LSM14BQ9BX40 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LSM14BQ9BX40 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LSM14BQ9BX40 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LSM14BQ9BX40 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LSM14BQ9BX40 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LSM14BQ9BX40 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LSM14BQ9BX40 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LSM14BQ9BX40 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LSM14BQ9BX40 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LSM14BQ9BX40 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LSM14BQ9BX40 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LSM14BQ9BX40 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms