Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SYCP2Q9BX26 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SYCP2Q9BX26 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SYCP2Q9BX26 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
SYCP2Q9BX26 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SYCP2Q9BX26 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
SYCP2Q9BX26 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
SYCP2Q9BX26 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
SYCP2Q9BX26 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
SYCP2Q9BX26 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
SYCP2Q9BX26 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
SYCP2Q9BX26 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
SYCP2Q9BX26 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SYCP2Q9BX26 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SYCP2Q9BX26 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SYCP2Q9BX26 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SYCP2Q9BX26 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SYCP2Q9BX26 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
SYCP2Q9BX26 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
SYCP2Q9BX26 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SYCP2Q9BX26 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
SYCP2Q9BX26 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SYCP2Q9BX26 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SYCP2Q9BX26 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SYCP2Q9BX26 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SYCP2Q9BX26 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
SYCP2Q9BX26 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
SYCP2Q9BX26 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.76
SYCP2Q9BX26 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
SYCP2Q9BX26 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
SYCP2Q9BX26 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
SYCP2Q9BX26 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
SYCP2Q9BX26 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SYCP2Q9BX26 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SYCP2Q9BX26 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SYCP2Q9BX26 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SYCP2Q9BX26 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SYCP2Q9BX26 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SYCP2Q9BX26 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SYCP2Q9BX26 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SYCP2Q9BX26 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
SYCP2Q9BX26 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
SYCP2Q9BX26 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SYCP2Q9BX26 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SYCP2Q9BX26 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SYCP2Q9BX26 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SYCP2Q9BX26 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SYCP2Q9BX26 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
SYCP2Q9BX26 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SYCP2Q9BX26 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SYCP2Q9BX26 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SYCP2Q9BX26 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SYCP2Q9BX26 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SYCP2Q9BX26 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SYCP2Q9BX26 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
SYCP2Q9BX26 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
SYCP2Q9BX26 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
SYCP2Q9BX26 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
SYCP2Q9BX26 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SYCP2Q9BX26 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
SYCP2Q9BX26 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SYCP2Q9BX26 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SYCP2Q9BX26 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SYCP2Q9BX26 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SYCP2Q9BX26 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SYCP2Q9BX26 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SYCP2Q9BX26 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SYCP2Q9BX26 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SYCP2Q9BX26 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SYCP2Q9BX26 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SYCP2Q9BX26 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SYCP2Q9BX26 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SYCP2Q9BX26 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SYCP2Q9BX26 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
SYCP2Q9BX26 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
SYCP2Q9BX26 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
SYCP2Q9BX26 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
SYCP2Q9BX26 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
SYCP2Q9BX26 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
SYCP2Q9BX26 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC32.2■■■□□ 2.75
SYCP2Q9BX26 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
SYCP2Q9BX26 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
SYCP2Q9BX26 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
SYCP2Q9BX26 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
SYCP2Q9BX26 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC32.2■■■□□ 2.74
SYCP2Q9BX26 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.74
SYCP2Q9BX26 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SYCP2Q9BX26 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SYCP2Q9BX26 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SYCP2Q9BX26 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
SYCP2Q9BX26 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SYCP2Q9BX26 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
SYCP2Q9BX26 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SYCP2Q9BX26 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SYCP2Q9BX26 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SYCP2Q9BX26 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SYCP2Q9BX26 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SYCP2Q9BX26 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SYCP2Q9BX26 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SYCP2Q9BX26 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms