Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVR0

HERC2P3, Putative HERC2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC2P3Q9BVR0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERC2P3Q9BVR0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERC2P3Q9BVR0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERC2P3Q9BVR0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERC2P3Q9BVR0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERC2P3Q9BVR0 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERC2P3Q9BVR0 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERC2P3Q9BVR0 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERC2P3Q9BVR0 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERC2P3Q9BVR0 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HERC2P3Q9BVR0 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERC2P3Q9BVR0 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERC2P3Q9BVR0 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERC2P3Q9BVR0 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERC2P3Q9BVR0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HERC2P3Q9BVR0 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERC2P3Q9BVR0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERC2P3Q9BVR0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERC2P3Q9BVR0 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERC2P3Q9BVR0 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERC2P3Q9BVR0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERC2P3Q9BVR0 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERC2P3Q9BVR0 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERC2P3Q9BVR0 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HERC2P3Q9BVR0 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERC2P3Q9BVR0 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERC2P3Q9BVR0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERC2P3Q9BVR0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERC2P3Q9BVR0 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERC2P3Q9BVR0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERC2P3Q9BVR0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HERC2P3Q9BVR0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HERC2P3Q9BVR0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HERC2P3Q9BVR0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HERC2P3Q9BVR0 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HERC2P3Q9BVR0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HERC2P3Q9BVR0 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HERC2P3Q9BVR0 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HERC2P3Q9BVR0 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HERC2P3Q9BVR0 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HERC2P3Q9BVR0 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HERC2P3Q9BVR0 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HERC2P3Q9BVR0 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HERC2P3Q9BVR0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HERC2P3Q9BVR0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HERC2P3Q9BVR0 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HERC2P3Q9BVR0 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HERC2P3Q9BVR0 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HERC2P3Q9BVR0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HERC2P3Q9BVR0 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HERC2P3Q9BVR0 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HERC2P3Q9BVR0 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HERC2P3Q9BVR0 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HERC2P3Q9BVR0 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HERC2P3Q9BVR0 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HERC2P3Q9BVR0 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HERC2P3Q9BVR0 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HERC2P3Q9BVR0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HERC2P3Q9BVR0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HERC2P3Q9BVR0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HERC2P3Q9BVR0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HERC2P3Q9BVR0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HERC2P3Q9BVR0 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERC2P3Q9BVR0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERC2P3Q9BVR0 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HERC2P3Q9BVR0 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERC2P3Q9BVR0 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERC2P3Q9BVR0 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERC2P3Q9BVR0 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERC2P3Q9BVR0 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HERC2P3Q9BVR0 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERC2P3Q9BVR0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERC2P3Q9BVR0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERC2P3Q9BVR0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERC2P3Q9BVR0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERC2P3Q9BVR0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERC2P3Q9BVR0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERC2P3Q9BVR0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERC2P3Q9BVR0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERC2P3Q9BVR0 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERC2P3Q9BVR0 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERC2P3Q9BVR0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HERC2P3Q9BVR0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HERC2P3Q9BVR0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HERC2P3Q9BVR0 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HERC2P3Q9BVR0 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HERC2P3Q9BVR0 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HERC2P3Q9BVR0 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HERC2P3Q9BVR0 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HERC2P3Q9BVR0 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HERC2P3Q9BVR0 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HERC2P3Q9BVR0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HERC2P3Q9BVR0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HERC2P3Q9BVR0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HERC2P3Q9BVR0 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HERC2P3Q9BVR0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERC2P3Q9BVR0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERC2P3Q9BVR0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERC2P3Q9BVR0 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERC2P3Q9BVR0 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms