Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRA2

TXNDC17, Thioredoxin domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC17Q9BRA2 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms