Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR77

CCDC77, Coiled-coil domain-containing protein 77, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC77Q9BR77 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC77Q9BR77 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC77Q9BR77 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC77Q9BR77 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC77Q9BR77 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC77Q9BR77 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC77Q9BR77 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC77Q9BR77 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC77Q9BR77 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms