Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LPIN3Q9BQK8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LPIN3Q9BQK8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LPIN3Q9BQK8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LPIN3Q9BQK8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LPIN3Q9BQK8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LPIN3Q9BQK8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LPIN3Q9BQK8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LPIN3Q9BQK8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LPIN3Q9BQK8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LPIN3Q9BQK8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LPIN3Q9BQK8 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LPIN3Q9BQK8 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LPIN3Q9BQK8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LPIN3Q9BQK8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LPIN3Q9BQK8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LPIN3Q9BQK8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LPIN3Q9BQK8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LPIN3Q9BQK8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LPIN3Q9BQK8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LPIN3Q9BQK8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LPIN3Q9BQK8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LPIN3Q9BQK8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LPIN3Q9BQK8 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LPIN3Q9BQK8 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LPIN3Q9BQK8 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LPIN3Q9BQK8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LPIN3Q9BQK8 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LPIN3Q9BQK8 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LPIN3Q9BQK8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LPIN3Q9BQK8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LPIN3Q9BQK8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LPIN3Q9BQK8 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LPIN3Q9BQK8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LPIN3Q9BQK8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LPIN3Q9BQK8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LPIN3Q9BQK8 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LPIN3Q9BQK8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LPIN3Q9BQK8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LPIN3Q9BQK8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LPIN3Q9BQK8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LPIN3Q9BQK8 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LPIN3Q9BQK8 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LPIN3Q9BQK8 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LPIN3Q9BQK8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LPIN3Q9BQK8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LPIN3Q9BQK8 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LPIN3Q9BQK8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LPIN3Q9BQK8 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LPIN3Q9BQK8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LPIN3Q9BQK8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LPIN3Q9BQK8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LPIN3Q9BQK8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LPIN3Q9BQK8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LPIN3Q9BQK8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LPIN3Q9BQK8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LPIN3Q9BQK8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LPIN3Q9BQK8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LPIN3Q9BQK8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LPIN3Q9BQK8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LPIN3Q9BQK8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LPIN3Q9BQK8 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LPIN3Q9BQK8 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LPIN3Q9BQK8 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LPIN3Q9BQK8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LPIN3Q9BQK8 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LPIN3Q9BQK8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LPIN3Q9BQK8 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LPIN3Q9BQK8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LPIN3Q9BQK8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LPIN3Q9BQK8 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LPIN3Q9BQK8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LPIN3Q9BQK8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LPIN3Q9BQK8 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LPIN3Q9BQK8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LPIN3Q9BQK8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LPIN3Q9BQK8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LPIN3Q9BQK8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LPIN3Q9BQK8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LPIN3Q9BQK8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LPIN3Q9BQK8 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LPIN3Q9BQK8 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LPIN3Q9BQK8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LPIN3Q9BQK8 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LPIN3Q9BQK8 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LPIN3Q9BQK8 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LPIN3Q9BQK8 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LPIN3Q9BQK8 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LPIN3Q9BQK8 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LPIN3Q9BQK8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LPIN3Q9BQK8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LPIN3Q9BQK8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LPIN3Q9BQK8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LPIN3Q9BQK8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LPIN3Q9BQK8 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LPIN3Q9BQK8 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LPIN3Q9BQK8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LPIN3Q9BQK8 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LPIN3Q9BQK8 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LPIN3Q9BQK8 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms