Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPOCK3Q9BQ16 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPOCK3Q9BQ16 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPOCK3Q9BQ16 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPOCK3Q9BQ16 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPOCK3Q9BQ16 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPOCK3Q9BQ16 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPOCK3Q9BQ16 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPOCK3Q9BQ16 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPOCK3Q9BQ16 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPOCK3Q9BQ16 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPOCK3Q9BQ16 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPOCK3Q9BQ16 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPOCK3Q9BQ16 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPOCK3Q9BQ16 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPOCK3Q9BQ16 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPOCK3Q9BQ16 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPOCK3Q9BQ16 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPOCK3Q9BQ16 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SPOCK3Q9BQ16 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPOCK3Q9BQ16 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPOCK3Q9BQ16 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPOCK3Q9BQ16 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPOCK3Q9BQ16 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPOCK3Q9BQ16 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPOCK3Q9BQ16 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPOCK3Q9BQ16 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPOCK3Q9BQ16 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPOCK3Q9BQ16 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPOCK3Q9BQ16 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPOCK3Q9BQ16 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPOCK3Q9BQ16 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPOCK3Q9BQ16 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPOCK3Q9BQ16 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPOCK3Q9BQ16 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPOCK3Q9BQ16 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPOCK3Q9BQ16 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPOCK3Q9BQ16 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPOCK3Q9BQ16 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPOCK3Q9BQ16 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPOCK3Q9BQ16 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPOCK3Q9BQ16 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPOCK3Q9BQ16 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPOCK3Q9BQ16 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPOCK3Q9BQ16 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPOCK3Q9BQ16 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SPOCK3Q9BQ16 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPOCK3Q9BQ16 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPOCK3Q9BQ16 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPOCK3Q9BQ16 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPOCK3Q9BQ16 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPOCK3Q9BQ16 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPOCK3Q9BQ16 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPOCK3Q9BQ16 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPOCK3Q9BQ16 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPOCK3Q9BQ16 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPOCK3Q9BQ16 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPOCK3Q9BQ16 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPOCK3Q9BQ16 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPOCK3Q9BQ16 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPOCK3Q9BQ16 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPOCK3Q9BQ16 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPOCK3Q9BQ16 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPOCK3Q9BQ16 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPOCK3Q9BQ16 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPOCK3Q9BQ16 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPOCK3Q9BQ16 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPOCK3Q9BQ16 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPOCK3Q9BQ16 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPOCK3Q9BQ16 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPOCK3Q9BQ16 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SPOCK3Q9BQ16 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPOCK3Q9BQ16 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPOCK3Q9BQ16 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SPOCK3Q9BQ16 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPOCK3Q9BQ16 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SPOCK3Q9BQ16 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPOCK3Q9BQ16 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPOCK3Q9BQ16 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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