Protein–RNA interactions for Protein: Q99653

CHP1, Calcineurin B homologous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHP1Q99653 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHP1Q99653 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHP1Q99653 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CHP1Q99653 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHP1Q99653 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHP1Q99653 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHP1Q99653 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHP1Q99653 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHP1Q99653 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHP1Q99653 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHP1Q99653 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHP1Q99653 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHP1Q99653 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHP1Q99653 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHP1Q99653 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHP1Q99653 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHP1Q99653 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHP1Q99653 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CHP1Q99653 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHP1Q99653 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHP1Q99653 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHP1Q99653 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHP1Q99653 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHP1Q99653 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHP1Q99653 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHP1Q99653 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHP1Q99653 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHP1Q99653 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHP1Q99653 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHP1Q99653 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHP1Q99653 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHP1Q99653 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHP1Q99653 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHP1Q99653 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHP1Q99653 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHP1Q99653 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHP1Q99653 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHP1Q99653 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHP1Q99653 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHP1Q99653 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHP1Q99653 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHP1Q99653 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHP1Q99653 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHP1Q99653 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CHP1Q99653 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHP1Q99653 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHP1Q99653 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHP1Q99653 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHP1Q99653 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHP1Q99653 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHP1Q99653 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHP1Q99653 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHP1Q99653 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHP1Q99653 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHP1Q99653 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHP1Q99653 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHP1Q99653 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHP1Q99653 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHP1Q99653 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CHP1Q99653 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHP1Q99653 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHP1Q99653 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CHP1Q99653 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHP1Q99653 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHP1Q99653 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHP1Q99653 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHP1Q99653 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHP1Q99653 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHP1Q99653 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHP1Q99653 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHP1Q99653 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CHP1Q99653 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CHP1Q99653 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHP1Q99653 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHP1Q99653 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHP1Q99653 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHP1Q99653 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHP1Q99653 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHP1Q99653 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHP1Q99653 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHP1Q99653 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHP1Q99653 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHP1Q99653 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHP1Q99653 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHP1Q99653 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CHP1Q99653 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CHP1Q99653 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHP1Q99653 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHP1Q99653 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHP1Q99653 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHP1Q99653 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHP1Q99653 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHP1Q99653 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHP1Q99653 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHP1Q99653 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHP1Q99653 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHP1Q99653 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHP1Q99653 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHP1Q99653 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CHP1Q99653 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms