Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHOX2BQ99453 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PHOX2BQ99453 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PHOX2BQ99453 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHOX2BQ99453 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHOX2BQ99453 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHOX2BQ99453 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PHOX2BQ99453 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHOX2BQ99453 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHOX2BQ99453 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHOX2BQ99453 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHOX2BQ99453 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHOX2BQ99453 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHOX2BQ99453 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHOX2BQ99453 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHOX2BQ99453 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHOX2BQ99453 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHOX2BQ99453 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHOX2BQ99453 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHOX2BQ99453 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHOX2BQ99453 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHOX2BQ99453 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHOX2BQ99453 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHOX2BQ99453 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHOX2BQ99453 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHOX2BQ99453 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHOX2BQ99453 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHOX2BQ99453 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHOX2BQ99453 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHOX2BQ99453 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHOX2BQ99453 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHOX2BQ99453 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHOX2BQ99453 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHOX2BQ99453 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHOX2BQ99453 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHOX2BQ99453 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHOX2BQ99453 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHOX2BQ99453 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHOX2BQ99453 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHOX2BQ99453 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHOX2BQ99453 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHOX2BQ99453 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHOX2BQ99453 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PHOX2BQ99453 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHOX2BQ99453 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHOX2BQ99453 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHOX2BQ99453 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHOX2BQ99453 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PHOX2BQ99453 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PHOX2BQ99453 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PHOX2BQ99453 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHOX2BQ99453 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHOX2BQ99453 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHOX2BQ99453 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHOX2BQ99453 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHOX2BQ99453 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHOX2BQ99453 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHOX2BQ99453 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PHOX2BQ99453 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHOX2BQ99453 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHOX2BQ99453 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHOX2BQ99453 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHOX2BQ99453 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PHOX2BQ99453 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PHOX2BQ99453 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHOX2BQ99453 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHOX2BQ99453 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHOX2BQ99453 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHOX2BQ99453 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHOX2BQ99453 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHOX2BQ99453 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHOX2BQ99453 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHOX2BQ99453 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHOX2BQ99453 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHOX2BQ99453 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHOX2BQ99453 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHOX2BQ99453 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHOX2BQ99453 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHOX2BQ99453 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHOX2BQ99453 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHOX2BQ99453 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHOX2BQ99453 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHOX2BQ99453 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHOX2BQ99453 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PHOX2BQ99453 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHOX2BQ99453 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHOX2BQ99453 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHOX2BQ99453 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHOX2BQ99453 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHOX2BQ99453 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHOX2BQ99453 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHOX2BQ99453 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHOX2BQ99453 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHOX2BQ99453 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHOX2BQ99453 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PHOX2BQ99453 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHOX2BQ99453 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHOX2BQ99453 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PHOX2BQ99453 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PHOX2BQ99453 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms