Protein–RNA interactions for Protein: Q96TA2

YME1L1, ATP-dependent zinc metalloprotease YME1L1, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YME1L1Q96TA2 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
YME1L1Q96TA2 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
YME1L1Q96TA2 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
YME1L1Q96TA2 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
YME1L1Q96TA2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
YME1L1Q96TA2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
YME1L1Q96TA2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
YME1L1Q96TA2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
YME1L1Q96TA2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
YME1L1Q96TA2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
YME1L1Q96TA2 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
YME1L1Q96TA2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
YME1L1Q96TA2 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
YME1L1Q96TA2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
YME1L1Q96TA2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
YME1L1Q96TA2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
YME1L1Q96TA2 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
YME1L1Q96TA2 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
YME1L1Q96TA2 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
YME1L1Q96TA2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
YME1L1Q96TA2 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
YME1L1Q96TA2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
YME1L1Q96TA2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
YME1L1Q96TA2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
YME1L1Q96TA2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
YME1L1Q96TA2 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
YME1L1Q96TA2 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
YME1L1Q96TA2 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
YME1L1Q96TA2 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
YME1L1Q96TA2 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
YME1L1Q96TA2 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
YME1L1Q96TA2 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
YME1L1Q96TA2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
YME1L1Q96TA2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
YME1L1Q96TA2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
YME1L1Q96TA2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
YME1L1Q96TA2 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
YME1L1Q96TA2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
YME1L1Q96TA2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
YME1L1Q96TA2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
YME1L1Q96TA2 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
YME1L1Q96TA2 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
YME1L1Q96TA2 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
YME1L1Q96TA2 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
YME1L1Q96TA2 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
YME1L1Q96TA2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
YME1L1Q96TA2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
YME1L1Q96TA2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
YME1L1Q96TA2 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
YME1L1Q96TA2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
YME1L1Q96TA2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
YME1L1Q96TA2 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
YME1L1Q96TA2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
YME1L1Q96TA2 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
YME1L1Q96TA2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
YME1L1Q96TA2 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
YME1L1Q96TA2 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
YME1L1Q96TA2 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
YME1L1Q96TA2 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
YME1L1Q96TA2 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
YME1L1Q96TA2 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
YME1L1Q96TA2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
YME1L1Q96TA2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
YME1L1Q96TA2 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
YME1L1Q96TA2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
YME1L1Q96TA2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
YME1L1Q96TA2 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
YME1L1Q96TA2 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
YME1L1Q96TA2 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
YME1L1Q96TA2 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
YME1L1Q96TA2 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
YME1L1Q96TA2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
YME1L1Q96TA2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
YME1L1Q96TA2 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
YME1L1Q96TA2 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
YME1L1Q96TA2 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
YME1L1Q96TA2 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
YME1L1Q96TA2 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
YME1L1Q96TA2 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
YME1L1Q96TA2 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
YME1L1Q96TA2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
YME1L1Q96TA2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
YME1L1Q96TA2 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
YME1L1Q96TA2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
YME1L1Q96TA2 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
YME1L1Q96TA2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
YME1L1Q96TA2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
YME1L1Q96TA2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
YME1L1Q96TA2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
YME1L1Q96TA2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
YME1L1Q96TA2 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
YME1L1Q96TA2 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
YME1L1Q96TA2 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
YME1L1Q96TA2 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
YME1L1Q96TA2 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
YME1L1Q96TA2 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
YME1L1Q96TA2 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
YME1L1Q96TA2 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
YME1L1Q96TA2 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
YME1L1Q96TA2 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms