Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS0

TGS1, Trimethylguanosine synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGS1Q96RS0 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TGS1Q96RS0 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TGS1Q96RS0 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TGS1Q96RS0 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TGS1Q96RS0 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TGS1Q96RS0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TGS1Q96RS0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TGS1Q96RS0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TGS1Q96RS0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TGS1Q96RS0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TGS1Q96RS0 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TGS1Q96RS0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TGS1Q96RS0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TGS1Q96RS0 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TGS1Q96RS0 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TGS1Q96RS0 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TGS1Q96RS0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TGS1Q96RS0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TGS1Q96RS0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TGS1Q96RS0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TGS1Q96RS0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TGS1Q96RS0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TGS1Q96RS0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TGS1Q96RS0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TGS1Q96RS0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TGS1Q96RS0 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TGS1Q96RS0 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TGS1Q96RS0 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TGS1Q96RS0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TGS1Q96RS0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TGS1Q96RS0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TGS1Q96RS0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TGS1Q96RS0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TGS1Q96RS0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TGS1Q96RS0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TGS1Q96RS0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TGS1Q96RS0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TGS1Q96RS0 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TGS1Q96RS0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TGS1Q96RS0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TGS1Q96RS0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TGS1Q96RS0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TGS1Q96RS0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TGS1Q96RS0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TGS1Q96RS0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TGS1Q96RS0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TGS1Q96RS0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TGS1Q96RS0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TGS1Q96RS0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TGS1Q96RS0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TGS1Q96RS0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TGS1Q96RS0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TGS1Q96RS0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TGS1Q96RS0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TGS1Q96RS0 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TGS1Q96RS0 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TGS1Q96RS0 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TGS1Q96RS0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TGS1Q96RS0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TGS1Q96RS0 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TGS1Q96RS0 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TGS1Q96RS0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TGS1Q96RS0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TGS1Q96RS0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TGS1Q96RS0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TGS1Q96RS0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TGS1Q96RS0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TGS1Q96RS0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TGS1Q96RS0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TGS1Q96RS0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TGS1Q96RS0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TGS1Q96RS0 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TGS1Q96RS0 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TGS1Q96RS0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TGS1Q96RS0 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TGS1Q96RS0 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TGS1Q96RS0 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TGS1Q96RS0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TGS1Q96RS0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TGS1Q96RS0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TGS1Q96RS0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TGS1Q96RS0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TGS1Q96RS0 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TGS1Q96RS0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TGS1Q96RS0 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TGS1Q96RS0 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TGS1Q96RS0 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TGS1Q96RS0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TGS1Q96RS0 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TGS1Q96RS0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TGS1Q96RS0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TGS1Q96RS0 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TGS1Q96RS0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TGS1Q96RS0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TGS1Q96RS0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TGS1Q96RS0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TGS1Q96RS0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TGS1Q96RS0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TGS1Q96RS0 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TGS1Q96RS0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms