Protein–RNA interactions for Protein: Q96RL1

UIMC1, BRCA1-A complex subunit RAP80, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UIMC1Q96RL1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UIMC1Q96RL1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UIMC1Q96RL1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UIMC1Q96RL1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UIMC1Q96RL1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
UIMC1Q96RL1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UIMC1Q96RL1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UIMC1Q96RL1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UIMC1Q96RL1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UIMC1Q96RL1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
UIMC1Q96RL1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UIMC1Q96RL1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UIMC1Q96RL1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UIMC1Q96RL1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UIMC1Q96RL1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UIMC1Q96RL1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UIMC1Q96RL1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UIMC1Q96RL1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UIMC1Q96RL1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UIMC1Q96RL1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UIMC1Q96RL1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UIMC1Q96RL1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UIMC1Q96RL1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UIMC1Q96RL1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UIMC1Q96RL1 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
UIMC1Q96RL1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UIMC1Q96RL1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UIMC1Q96RL1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UIMC1Q96RL1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UIMC1Q96RL1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
UIMC1Q96RL1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
UIMC1Q96RL1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
UIMC1Q96RL1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
UIMC1Q96RL1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
UIMC1Q96RL1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UIMC1Q96RL1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UIMC1Q96RL1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UIMC1Q96RL1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UIMC1Q96RL1 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UIMC1Q96RL1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UIMC1Q96RL1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UIMC1Q96RL1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UIMC1Q96RL1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UIMC1Q96RL1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UIMC1Q96RL1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UIMC1Q96RL1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UIMC1Q96RL1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UIMC1Q96RL1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UIMC1Q96RL1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UIMC1Q96RL1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UIMC1Q96RL1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UIMC1Q96RL1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UIMC1Q96RL1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UIMC1Q96RL1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UIMC1Q96RL1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UIMC1Q96RL1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UIMC1Q96RL1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UIMC1Q96RL1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UIMC1Q96RL1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
UIMC1Q96RL1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UIMC1Q96RL1 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UIMC1Q96RL1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UIMC1Q96RL1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UIMC1Q96RL1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UIMC1Q96RL1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UIMC1Q96RL1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UIMC1Q96RL1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UIMC1Q96RL1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UIMC1Q96RL1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UIMC1Q96RL1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UIMC1Q96RL1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UIMC1Q96RL1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UIMC1Q96RL1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UIMC1Q96RL1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UIMC1Q96RL1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UIMC1Q96RL1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UIMC1Q96RL1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UIMC1Q96RL1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UIMC1Q96RL1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
UIMC1Q96RL1 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UIMC1Q96RL1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UIMC1Q96RL1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UIMC1Q96RL1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UIMC1Q96RL1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UIMC1Q96RL1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UIMC1Q96RL1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UIMC1Q96RL1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UIMC1Q96RL1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UIMC1Q96RL1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UIMC1Q96RL1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UIMC1Q96RL1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UIMC1Q96RL1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UIMC1Q96RL1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UIMC1Q96RL1 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UIMC1Q96RL1 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UIMC1Q96RL1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UIMC1Q96RL1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
UIMC1Q96RL1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UIMC1Q96RL1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UIMC1Q96RL1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms