Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CICQ96RK0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CICQ96RK0 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CICQ96RK0 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CICQ96RK0 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CICQ96RK0 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CICQ96RK0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CICQ96RK0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CICQ96RK0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CICQ96RK0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CICQ96RK0 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CICQ96RK0 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CICQ96RK0 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CICQ96RK0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CICQ96RK0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CICQ96RK0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CICQ96RK0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CICQ96RK0 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CICQ96RK0 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CICQ96RK0 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CICQ96RK0 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CICQ96RK0 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CICQ96RK0 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CICQ96RK0 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CICQ96RK0 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CICQ96RK0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CICQ96RK0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CICQ96RK0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CICQ96RK0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CICQ96RK0 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CICQ96RK0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CICQ96RK0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CICQ96RK0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CICQ96RK0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CICQ96RK0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CICQ96RK0 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CICQ96RK0 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CICQ96RK0 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CICQ96RK0 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CICQ96RK0 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CICQ96RK0 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CICQ96RK0 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CICQ96RK0 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
CICQ96RK0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CICQ96RK0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CICQ96RK0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CICQ96RK0 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CICQ96RK0 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CICQ96RK0 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CICQ96RK0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CICQ96RK0 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CICQ96RK0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CICQ96RK0 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CICQ96RK0 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CICQ96RK0 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CICQ96RK0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CICQ96RK0 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CICQ96RK0 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CICQ96RK0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CICQ96RK0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CICQ96RK0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CICQ96RK0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CICQ96RK0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CICQ96RK0 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CICQ96RK0 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CICQ96RK0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CICQ96RK0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CICQ96RK0 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CICQ96RK0 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CICQ96RK0 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CICQ96RK0 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CICQ96RK0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CICQ96RK0 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CICQ96RK0 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CICQ96RK0 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CICQ96RK0 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CICQ96RK0 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CICQ96RK0 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CICQ96RK0 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CICQ96RK0 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CICQ96RK0 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CICQ96RK0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CICQ96RK0 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CICQ96RK0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CICQ96RK0 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CICQ96RK0 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CICQ96RK0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CICQ96RK0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CICQ96RK0 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CICQ96RK0 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CICQ96RK0 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CICQ96RK0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CICQ96RK0 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CICQ96RK0 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CICQ96RK0 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CICQ96RK0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CICQ96RK0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CICQ96RK0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CICQ96RK0 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CICQ96RK0 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms