Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMG1Q96Q15 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SMG1Q96Q15 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMG1Q96Q15 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMG1Q96Q15 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMG1Q96Q15 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMG1Q96Q15 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMG1Q96Q15 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMG1Q96Q15 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMG1Q96Q15 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMG1Q96Q15 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMG1Q96Q15 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMG1Q96Q15 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMG1Q96Q15 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMG1Q96Q15 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMG1Q96Q15 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMG1Q96Q15 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMG1Q96Q15 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMG1Q96Q15 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SMG1Q96Q15 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMG1Q96Q15 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMG1Q96Q15 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMG1Q96Q15 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMG1Q96Q15 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMG1Q96Q15 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMG1Q96Q15 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMG1Q96Q15 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMG1Q96Q15 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMG1Q96Q15 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMG1Q96Q15 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMG1Q96Q15 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMG1Q96Q15 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMG1Q96Q15 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMG1Q96Q15 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMG1Q96Q15 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMG1Q96Q15 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMG1Q96Q15 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMG1Q96Q15 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SMG1Q96Q15 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SMG1Q96Q15 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMG1Q96Q15 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMG1Q96Q15 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMG1Q96Q15 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMG1Q96Q15 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMG1Q96Q15 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms