Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC85AQ96PX6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC85AQ96PX6 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC85AQ96PX6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC85AQ96PX6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC85AQ96PX6 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC85AQ96PX6 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC85AQ96PX6 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC85AQ96PX6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC85AQ96PX6 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC85AQ96PX6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC85AQ96PX6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC85AQ96PX6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC85AQ96PX6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC85AQ96PX6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC85AQ96PX6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC85AQ96PX6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC85AQ96PX6 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC85AQ96PX6 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC85AQ96PX6 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC85AQ96PX6 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC85AQ96PX6 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC85AQ96PX6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC85AQ96PX6 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC85AQ96PX6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC85AQ96PX6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC85AQ96PX6 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC85AQ96PX6 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC85AQ96PX6 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC85AQ96PX6 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC85AQ96PX6 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC85AQ96PX6 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC85AQ96PX6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC85AQ96PX6 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC85AQ96PX6 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC85AQ96PX6 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC85AQ96PX6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC85AQ96PX6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC85AQ96PX6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC85AQ96PX6 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC85AQ96PX6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC85AQ96PX6 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC85AQ96PX6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC85AQ96PX6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC85AQ96PX6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC85AQ96PX6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC85AQ96PX6 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC85AQ96PX6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC85AQ96PX6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC85AQ96PX6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC85AQ96PX6 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC85AQ96PX6 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC85AQ96PX6 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC85AQ96PX6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC85AQ96PX6 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC85AQ96PX6 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC85AQ96PX6 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC85AQ96PX6 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC85AQ96PX6 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC85AQ96PX6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC85AQ96PX6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC85AQ96PX6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC85AQ96PX6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC85AQ96PX6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC85AQ96PX6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC85AQ96PX6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC85AQ96PX6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC85AQ96PX6 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC85AQ96PX6 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC85AQ96PX6 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC85AQ96PX6 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC85AQ96PX6 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC85AQ96PX6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC85AQ96PX6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC85AQ96PX6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC85AQ96PX6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC85AQ96PX6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC85AQ96PX6 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC85AQ96PX6 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC85AQ96PX6 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC85AQ96PX6 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC85AQ96PX6 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC85AQ96PX6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC85AQ96PX6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC85AQ96PX6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC85AQ96PX6 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC85AQ96PX6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC85AQ96PX6 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC85AQ96PX6 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC85AQ96PX6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC85AQ96PX6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC85AQ96PX6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC85AQ96PX6 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC85AQ96PX6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC85AQ96PX6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC85AQ96PX6 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC85AQ96PX6 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC85AQ96PX6 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC85AQ96PX6 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC85AQ96PX6 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms