Protein–RNA interactions for Protein: Q96PC3

AP1S3, AP-1 complex subunit sigma-3, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S3Q96PC3 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1S3Q96PC3 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1S3Q96PC3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1S3Q96PC3 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1S3Q96PC3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1S3Q96PC3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1S3Q96PC3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1S3Q96PC3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1S3Q96PC3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1S3Q96PC3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1S3Q96PC3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1S3Q96PC3 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1S3Q96PC3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1S3Q96PC3 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1S3Q96PC3 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1S3Q96PC3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1S3Q96PC3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1S3Q96PC3 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1S3Q96PC3 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP1S3Q96PC3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP1S3Q96PC3 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP1S3Q96PC3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP1S3Q96PC3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
AP1S3Q96PC3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP1S3Q96PC3 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP1S3Q96PC3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP1S3Q96PC3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP1S3Q96PC3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
AP1S3Q96PC3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP1S3Q96PC3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP1S3Q96PC3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP1S3Q96PC3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP1S3Q96PC3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AP1S3Q96PC3 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AP1S3Q96PC3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AP1S3Q96PC3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AP1S3Q96PC3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AP1S3Q96PC3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AP1S3Q96PC3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AP1S3Q96PC3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP1S3Q96PC3 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP1S3Q96PC3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP1S3Q96PC3 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP1S3Q96PC3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP1S3Q96PC3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP1S3Q96PC3 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP1S3Q96PC3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AP1S3Q96PC3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP1S3Q96PC3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP1S3Q96PC3 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP1S3Q96PC3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP1S3Q96PC3 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP1S3Q96PC3 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP1S3Q96PC3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP1S3Q96PC3 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP1S3Q96PC3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP1S3Q96PC3 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP1S3Q96PC3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP1S3Q96PC3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AP1S3Q96PC3 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP1S3Q96PC3 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP1S3Q96PC3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP1S3Q96PC3 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AP1S3Q96PC3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP1S3Q96PC3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP1S3Q96PC3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP1S3Q96PC3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
AP1S3Q96PC3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC16■□□□□ 0.15
AP1S3Q96PC3 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP1S3Q96PC3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AP1S3Q96PC3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AP1S3Q96PC3 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16■□□□□ 0.15
AP1S3Q96PC3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP1S3Q96PC3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP1S3Q96PC3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP1S3Q96PC3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
AP1S3Q96PC3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP1S3Q96PC3 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP1S3Q96PC3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP1S3Q96PC3 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP1S3Q96PC3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP1S3Q96PC3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP1S3Q96PC3 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP1S3Q96PC3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP1S3Q96PC3 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP1S3Q96PC3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP1S3Q96PC3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP1S3Q96PC3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP1S3Q96PC3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP1S3Q96PC3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP1S3Q96PC3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP1S3Q96PC3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP1S3Q96PC3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP1S3Q96PC3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP1S3Q96PC3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP1S3Q96PC3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP1S3Q96PC3 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP1S3Q96PC3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP1S3Q96PC3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP1S3Q96PC3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms