Protein–RNA interactions for Protein: Q96MR9

ZNF560, Zinc finger protein 560, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF560Q96MR9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF560Q96MR9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF560Q96MR9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF560Q96MR9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF560Q96MR9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF560Q96MR9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF560Q96MR9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF560Q96MR9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF560Q96MR9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF560Q96MR9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF560Q96MR9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF560Q96MR9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF560Q96MR9 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF560Q96MR9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF560Q96MR9 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF560Q96MR9 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF560Q96MR9 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF560Q96MR9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF560Q96MR9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF560Q96MR9 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF560Q96MR9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF560Q96MR9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF560Q96MR9 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF560Q96MR9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF560Q96MR9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF560Q96MR9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF560Q96MR9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF560Q96MR9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF560Q96MR9 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF560Q96MR9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF560Q96MR9 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF560Q96MR9 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF560Q96MR9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF560Q96MR9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF560Q96MR9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF560Q96MR9 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF560Q96MR9 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF560Q96MR9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF560Q96MR9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF560Q96MR9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF560Q96MR9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF560Q96MR9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF560Q96MR9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF560Q96MR9 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF560Q96MR9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF560Q96MR9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF560Q96MR9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF560Q96MR9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF560Q96MR9 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF560Q96MR9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF560Q96MR9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF560Q96MR9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF560Q96MR9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF560Q96MR9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF560Q96MR9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF560Q96MR9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF560Q96MR9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF560Q96MR9 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF560Q96MR9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF560Q96MR9 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF560Q96MR9 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF560Q96MR9 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF560Q96MR9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF560Q96MR9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF560Q96MR9 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF560Q96MR9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF560Q96MR9 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF560Q96MR9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF560Q96MR9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF560Q96MR9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF560Q96MR9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF560Q96MR9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF560Q96MR9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF560Q96MR9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF560Q96MR9 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF560Q96MR9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF560Q96MR9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF560Q96MR9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF560Q96MR9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF560Q96MR9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF560Q96MR9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF560Q96MR9 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF560Q96MR9 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF560Q96MR9 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF560Q96MR9 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF560Q96MR9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF560Q96MR9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF560Q96MR9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF560Q96MR9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF560Q96MR9 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF560Q96MR9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF560Q96MR9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF560Q96MR9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF560Q96MR9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF560Q96MR9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF560Q96MR9 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF560Q96MR9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF560Q96MR9 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF560Q96MR9 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF560Q96MR9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms