Protein–RNA interactions for Protein: Q96MN9

ZNF488, Zinc finger protein 488, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF488Q96MN9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms