Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN7

RPGRIP1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPGRIP1Q96KN7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPGRIP1Q96KN7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPGRIP1Q96KN7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPGRIP1Q96KN7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPGRIP1Q96KN7 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RPGRIP1Q96KN7 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPGRIP1Q96KN7 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPGRIP1Q96KN7 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPGRIP1Q96KN7 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPGRIP1Q96KN7 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPGRIP1Q96KN7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPGRIP1Q96KN7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPGRIP1Q96KN7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPGRIP1Q96KN7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPGRIP1Q96KN7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPGRIP1Q96KN7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPGRIP1Q96KN7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPGRIP1Q96KN7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPGRIP1Q96KN7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPGRIP1Q96KN7 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPGRIP1Q96KN7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPGRIP1Q96KN7 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RPGRIP1Q96KN7 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RPGRIP1Q96KN7 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RPGRIP1Q96KN7 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPGRIP1Q96KN7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPGRIP1Q96KN7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RPGRIP1Q96KN7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPGRIP1Q96KN7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPGRIP1Q96KN7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPGRIP1Q96KN7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPGRIP1Q96KN7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPGRIP1Q96KN7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPGRIP1Q96KN7 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPGRIP1Q96KN7 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPGRIP1Q96KN7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RPGRIP1Q96KN7 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RPGRIP1Q96KN7 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RPGRIP1Q96KN7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RPGRIP1Q96KN7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPGRIP1Q96KN7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RPGRIP1Q96KN7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPGRIP1Q96KN7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPGRIP1Q96KN7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPGRIP1Q96KN7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPGRIP1Q96KN7 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPGRIP1Q96KN7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPGRIP1Q96KN7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPGRIP1Q96KN7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPGRIP1Q96KN7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPGRIP1Q96KN7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPGRIP1Q96KN7 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPGRIP1Q96KN7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPGRIP1Q96KN7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPGRIP1Q96KN7 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RPGRIP1Q96KN7 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPGRIP1Q96KN7 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPGRIP1Q96KN7 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPGRIP1Q96KN7 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPGRIP1Q96KN7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RPGRIP1Q96KN7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPGRIP1Q96KN7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPGRIP1Q96KN7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPGRIP1Q96KN7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPGRIP1Q96KN7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPGRIP1Q96KN7 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPGRIP1Q96KN7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPGRIP1Q96KN7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPGRIP1Q96KN7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPGRIP1Q96KN7 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPGRIP1Q96KN7 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPGRIP1Q96KN7 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RPGRIP1Q96KN7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPGRIP1Q96KN7 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPGRIP1Q96KN7 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RPGRIP1Q96KN7 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPGRIP1Q96KN7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPGRIP1Q96KN7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPGRIP1Q96KN7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPGRIP1Q96KN7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPGRIP1Q96KN7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPGRIP1Q96KN7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPGRIP1Q96KN7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RPGRIP1Q96KN7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPGRIP1Q96KN7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPGRIP1Q96KN7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPGRIP1Q96KN7 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPGRIP1Q96KN7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPGRIP1Q96KN7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPGRIP1Q96KN7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPGRIP1Q96KN7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPGRIP1Q96KN7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPGRIP1Q96KN7 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPGRIP1Q96KN7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPGRIP1Q96KN7 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPGRIP1Q96KN7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPGRIP1Q96KN7 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPGRIP1Q96KN7 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPGRIP1Q96KN7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPGRIP1Q96KN7 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms