Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms