Protein–RNA interactions for Protein: Q96JY6

PDLIM2, PDZ and LIM domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM2Q96JY6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDLIM2Q96JY6 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDLIM2Q96JY6 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDLIM2Q96JY6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDLIM2Q96JY6 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDLIM2Q96JY6 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDLIM2Q96JY6 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDLIM2Q96JY6 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDLIM2Q96JY6 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDLIM2Q96JY6 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDLIM2Q96JY6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDLIM2Q96JY6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PDLIM2Q96JY6 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDLIM2Q96JY6 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDLIM2Q96JY6 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDLIM2Q96JY6 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDLIM2Q96JY6 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDLIM2Q96JY6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDLIM2Q96JY6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDLIM2Q96JY6 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDLIM2Q96JY6 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDLIM2Q96JY6 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDLIM2Q96JY6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDLIM2Q96JY6 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDLIM2Q96JY6 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDLIM2Q96JY6 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDLIM2Q96JY6 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDLIM2Q96JY6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDLIM2Q96JY6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDLIM2Q96JY6 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDLIM2Q96JY6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDLIM2Q96JY6 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDLIM2Q96JY6 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDLIM2Q96JY6 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDLIM2Q96JY6 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDLIM2Q96JY6 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDLIM2Q96JY6 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDLIM2Q96JY6 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDLIM2Q96JY6 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDLIM2Q96JY6 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDLIM2Q96JY6 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDLIM2Q96JY6 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDLIM2Q96JY6 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDLIM2Q96JY6 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDLIM2Q96JY6 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDLIM2Q96JY6 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDLIM2Q96JY6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDLIM2Q96JY6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDLIM2Q96JY6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDLIM2Q96JY6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDLIM2Q96JY6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDLIM2Q96JY6 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PDLIM2Q96JY6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDLIM2Q96JY6 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDLIM2Q96JY6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDLIM2Q96JY6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDLIM2Q96JY6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDLIM2Q96JY6 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDLIM2Q96JY6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDLIM2Q96JY6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDLIM2Q96JY6 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDLIM2Q96JY6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDLIM2Q96JY6 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDLIM2Q96JY6 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PDLIM2Q96JY6 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
PDLIM2Q96JY6 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PDLIM2Q96JY6 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PDLIM2Q96JY6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDLIM2Q96JY6 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDLIM2Q96JY6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDLIM2Q96JY6 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDLIM2Q96JY6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDLIM2Q96JY6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDLIM2Q96JY6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDLIM2Q96JY6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PDLIM2Q96JY6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDLIM2Q96JY6 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PDLIM2Q96JY6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDLIM2Q96JY6 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDLIM2Q96JY6 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDLIM2Q96JY6 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDLIM2Q96JY6 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDLIM2Q96JY6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDLIM2Q96JY6 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDLIM2Q96JY6 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDLIM2Q96JY6 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDLIM2Q96JY6 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDLIM2Q96JY6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDLIM2Q96JY6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDLIM2Q96JY6 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDLIM2Q96JY6 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDLIM2Q96JY6 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PDLIM2Q96JY6 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDLIM2Q96JY6 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDLIM2Q96JY6 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDLIM2Q96JY6 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDLIM2Q96JY6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDLIM2Q96JY6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDLIM2Q96JY6 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDLIM2Q96JY6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms