Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC136Q96JN2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC136Q96JN2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC136Q96JN2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC136Q96JN2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC136Q96JN2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC136Q96JN2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC136Q96JN2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC136Q96JN2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC136Q96JN2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC136Q96JN2 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC136Q96JN2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC136Q96JN2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC136Q96JN2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC136Q96JN2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC136Q96JN2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC136Q96JN2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC136Q96JN2 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC136Q96JN2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC136Q96JN2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC136Q96JN2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC136Q96JN2 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC136Q96JN2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC136Q96JN2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC136Q96JN2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC136Q96JN2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC136Q96JN2 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC136Q96JN2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC136Q96JN2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC136Q96JN2 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC136Q96JN2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC136Q96JN2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC136Q96JN2 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC136Q96JN2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC136Q96JN2 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC136Q96JN2 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC136Q96JN2 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC136Q96JN2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC136Q96JN2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC136Q96JN2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC136Q96JN2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC136Q96JN2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC136Q96JN2 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC136Q96JN2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC136Q96JN2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC136Q96JN2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC136Q96JN2 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC136Q96JN2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC136Q96JN2 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC136Q96JN2 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC136Q96JN2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC136Q96JN2 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC136Q96JN2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC136Q96JN2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC136Q96JN2 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC136Q96JN2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC136Q96JN2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC136Q96JN2 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC136Q96JN2 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC136Q96JN2 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC136Q96JN2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC136Q96JN2 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC136Q96JN2 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC136Q96JN2 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC136Q96JN2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC136Q96JN2 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC136Q96JN2 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC136Q96JN2 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC136Q96JN2 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC136Q96JN2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC136Q96JN2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC136Q96JN2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC136Q96JN2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC136Q96JN2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC136Q96JN2 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC136Q96JN2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC136Q96JN2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC136Q96JN2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC136Q96JN2 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC136Q96JN2 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC136Q96JN2 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC136Q96JN2 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC136Q96JN2 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC136Q96JN2 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC136Q96JN2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC136Q96JN2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC136Q96JN2 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC136Q96JN2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC136Q96JN2 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC136Q96JN2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC136Q96JN2 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC136Q96JN2 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC136Q96JN2 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC136Q96JN2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC136Q96JN2 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC136Q96JN2 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC136Q96JN2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC136Q96JN2 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC136Q96JN2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC136Q96JN2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms