Protein–RNA interactions for Protein: Q96IL0

APOPT1, Apoptogenic protein 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOPT1Q96IL0 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOPT1Q96IL0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOPT1Q96IL0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOPT1Q96IL0 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOPT1Q96IL0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOPT1Q96IL0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOPT1Q96IL0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOPT1Q96IL0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOPT1Q96IL0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOPT1Q96IL0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOPT1Q96IL0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
APOPT1Q96IL0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
APOPT1Q96IL0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOPT1Q96IL0 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
APOPT1Q96IL0 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOPT1Q96IL0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOPT1Q96IL0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOPT1Q96IL0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOPT1Q96IL0 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOPT1Q96IL0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOPT1Q96IL0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOPT1Q96IL0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOPT1Q96IL0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOPT1Q96IL0 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOPT1Q96IL0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOPT1Q96IL0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOPT1Q96IL0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOPT1Q96IL0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOPT1Q96IL0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOPT1Q96IL0 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOPT1Q96IL0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOPT1Q96IL0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOPT1Q96IL0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOPT1Q96IL0 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
APOPT1Q96IL0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
APOPT1Q96IL0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
APOPT1Q96IL0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
APOPT1Q96IL0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
APOPT1Q96IL0 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOPT1Q96IL0 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOPT1Q96IL0 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOPT1Q96IL0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOPT1Q96IL0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOPT1Q96IL0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
APOPT1Q96IL0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
APOPT1Q96IL0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOPT1Q96IL0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOPT1Q96IL0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
APOPT1Q96IL0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOPT1Q96IL0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOPT1Q96IL0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOPT1Q96IL0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOPT1Q96IL0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOPT1Q96IL0 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOPT1Q96IL0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOPT1Q96IL0 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOPT1Q96IL0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOPT1Q96IL0 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOPT1Q96IL0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOPT1Q96IL0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOPT1Q96IL0 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOPT1Q96IL0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOPT1Q96IL0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOPT1Q96IL0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOPT1Q96IL0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
APOPT1Q96IL0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOPT1Q96IL0 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOPT1Q96IL0 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOPT1Q96IL0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOPT1Q96IL0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOPT1Q96IL0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOPT1Q96IL0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOPT1Q96IL0 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOPT1Q96IL0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOPT1Q96IL0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOPT1Q96IL0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOPT1Q96IL0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOPT1Q96IL0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOPT1Q96IL0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
APOPT1Q96IL0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOPT1Q96IL0 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOPT1Q96IL0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOPT1Q96IL0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOPT1Q96IL0 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOPT1Q96IL0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOPT1Q96IL0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOPT1Q96IL0 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOPT1Q96IL0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOPT1Q96IL0 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOPT1Q96IL0 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOPT1Q96IL0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOPT1Q96IL0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOPT1Q96IL0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOPT1Q96IL0 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOPT1Q96IL0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOPT1Q96IL0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOPT1Q96IL0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOPT1Q96IL0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOPT1Q96IL0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOPT1Q96IL0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms