Protein–RNA interactions for Protein: Q96GQ7

DDX27, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX27, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX27Q96GQ7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX27Q96GQ7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX27Q96GQ7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX27Q96GQ7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX27Q96GQ7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX27Q96GQ7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX27Q96GQ7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX27Q96GQ7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX27Q96GQ7 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX27Q96GQ7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX27Q96GQ7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX27Q96GQ7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX27Q96GQ7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX27Q96GQ7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX27Q96GQ7 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX27Q96GQ7 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX27Q96GQ7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX27Q96GQ7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX27Q96GQ7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX27Q96GQ7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX27Q96GQ7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX27Q96GQ7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX27Q96GQ7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX27Q96GQ7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX27Q96GQ7 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX27Q96GQ7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX27Q96GQ7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX27Q96GQ7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX27Q96GQ7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX27Q96GQ7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX27Q96GQ7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX27Q96GQ7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX27Q96GQ7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX27Q96GQ7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX27Q96GQ7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX27Q96GQ7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX27Q96GQ7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX27Q96GQ7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX27Q96GQ7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX27Q96GQ7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX27Q96GQ7 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX27Q96GQ7 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX27Q96GQ7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX27Q96GQ7 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX27Q96GQ7 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX27Q96GQ7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX27Q96GQ7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX27Q96GQ7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX27Q96GQ7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX27Q96GQ7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX27Q96GQ7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
DDX27Q96GQ7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DDX27Q96GQ7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DDX27Q96GQ7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
DDX27Q96GQ7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DDX27Q96GQ7 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX27Q96GQ7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX27Q96GQ7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX27Q96GQ7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX27Q96GQ7 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX27Q96GQ7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX27Q96GQ7 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX27Q96GQ7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX27Q96GQ7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX27Q96GQ7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX27Q96GQ7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX27Q96GQ7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX27Q96GQ7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX27Q96GQ7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX27Q96GQ7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX27Q96GQ7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX27Q96GQ7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX27Q96GQ7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX27Q96GQ7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX27Q96GQ7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX27Q96GQ7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX27Q96GQ7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX27Q96GQ7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX27Q96GQ7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX27Q96GQ7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX27Q96GQ7 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX27Q96GQ7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX27Q96GQ7 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX27Q96GQ7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX27Q96GQ7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX27Q96GQ7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX27Q96GQ7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX27Q96GQ7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX27Q96GQ7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX27Q96GQ7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX27Q96GQ7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX27Q96GQ7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX27Q96GQ7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX27Q96GQ7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX27Q96GQ7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX27Q96GQ7 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX27Q96GQ7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX27Q96GQ7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX27Q96GQ7 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX27Q96GQ7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms